Cientistas Descobrem Como São As Redes De Células-Tronco E De Onde Elas Vieram

Pela Universidade de Copenhague | Phys.Org

12.Dez.2022

Peixes celacantos e outros animais. Crédito: Woranop Sukparangsi

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[Nota deste blog sobre este artigo: este artigo é uma peça evolucionista, logo entenda que o mesmo contém dados objetivos sim, mas possui o viés de confirmação evolucionista mas também possui o uso indevido pelos evolucionistas de linguagem teleológica, aristotelismo e o wishful thinking evolucionista de praxe, a ênfase adicionada não é por mera estética: evidencia vícios de linguagem teleológica descarados, dados claros onde se pode inferir o design inteligente por pura lógica, e evidencia a contraproducência do evolucionismo.]

Um coração batendo, um órgão complicado que bombeia sangue pelo corpo de animais e humanos, não é exatamente algo que você associa a uma placa de Petri em um laboratório.

Mas isso pode mudar no futuro e pode salvar a vida de pessoas cujos próprios órgãos falham. A pesquisa está agora um passo mais perto disso.

Para projetar órgãos artificiais, primeiro você precisa entender as células-tronco e as INSTRUÇÕES GENÉTICAS que GOVERNAM suas propriedades notáveis. O professor Joshua Mark Brickman, do Novo Nordisk Foundation Center for Stem Cell Medicine (reNEW), desenterrou as origens evolutivas de um gene MESTRE que atua em uma rede de que INSTRUI as células-tronco.

“O primeiro passo na é entender a de genes que sustenta as chamadas células-tronco pluripotentes. Entender como sua função foi APERFEIÇOADA na pode ajudar a fornecer conhecimento sobre como construir células-tronco melhores”, diz Joshua Mark Brickman.

Células-tronco pluripotentes são células-tronco que podem se desenvolver em todas as outras células; por exemplo, células cardíacas. Se entendermos como as células-tronco pluripotentes se desenvolvem em um coração, estaremos um passo mais perto de replicar esse processo em laboratório.

▪️ Um ‘fóssil vivo’ é a chave para entender as células-tronco

A propriedade pluripotente das células-tronco – o que significa que as células podem se desenvolver em qualquer outra célula – é algo tradicionalmente associado aos mamíferos.

Agora Brickman e seus colegas descobriram que o gene mestre que controla as células-tronco e dá suporte à pluripotência também existe em um peixe chamado celacanto. Em humanos e camundongos, esse gene é chamado OCT4, e os pesquisadores descobriram que a versão do celacanto poderia substituir a dos mamíferos nas células-tronco do camundongo.

Além do fato de o celacanto pertencer a uma classe diferente dos mamíferos, ele também é chamado de “fóssil vivo”, pois há aproximadamente 400 milhões de anos se desenvolveu na forma que tem hoje. Tem barbatanas em forma de membros e, portanto, acredita-se que se assemelhe aos primeiros animais a se moverem do mar para a terra.

“Ao estudar suas células, você pode voltar na evolução, por assim dizer“, explica a professora assistente Molly Lowndes.

O professor assistente Woranop Sukparangsi continua: “O fator central que CONTROLA a rede de genes nas células-tronco é encontrado no celacanto. Isso mostra que a rede JÁ EXISTIA NO INÍCIO DA EVOLUÇÃO, potencialmente há 400 milhões de anos”.

Ao estudar a rede em outras espécies, como este peixe, os pesquisadores podem destilar quais são os conceitos básicos que sustentam uma célula-tronco.

“A beleza de retroceder na evolução é que os organismos se tornam mais simples. Por exemplo, eles têm apenas uma cópia de alguns genes essenciais em vez de muitas versões. Assim, você pode começar a separar o que é realmente importante para as células-tronco e usar isso para melhorar a forma como você cultiva células-tronco em um prato”, diz a estudante Ph.D. Elena Morganti.

▪️ Tubarões, ratos e cangurus

Além dos pesquisadores descobrirem que a rede em torno das células-tronco é muito mais antiga do que se pensava e encontrada em espécies antigas, eles também aprenderam como exatamente a evolução modificou a rede de genes para suportar .

Os pesquisadores analisaram os genes das células-tronco de mais de 40 animais, incluindo tubarões, camundongos e cangurus. Os animais foram selecionados para fornecer uma boa amostragem dos principais pontos de ramificação na evolução.

Os pesquisadores usaram para construir modelos tridimensionais das diferentes proteínas OCT4. Os pesquisadores puderam ver que a estrutura geral da proteína é mantida ao longo da evolução. Embora as regiões dessas proteínas conhecidas por serem importantes para NÃO MUDEM, as diferenças específicas da espécie em regiões aparentemente não relacionadas dessas proteínas alteram sua orientação, afetando potencialmente o quão bem ela suporta a pluripotência.

“Esta é uma descoberta muito empolgante sobre a evolução que não teria sido possível antes do advento de novas tecnologias. Você pode ver isso como uma EVOLUÇÃO INTELIGENTE pensando: ‘Não mexemos no motor do carro, mas PODEMOS movê-lo ao redor e MELHORAR o trem de força para ver se ele faz o carro andar mais rápido'”, diz Brickman.

O artigo foi publicado na revista Nature Communications.

O estudo é um projeto colaborativo que abrange Austrália, Japão e Europa, com parcerias estratégicas vitais com os grupos de Sylvie Mazan no Observatório Oceanológico de Banyuls-sur-Mer na França e o professor Guillermo Montoya no Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research na Universidade de Copenhague.

[Ênfase adicionada]

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Mais informações: Woranop Sukparangsi et al, Evolutionary origin of vertebrate OCT4/POU5 functions in supporting pluripotency, Nature Communications (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-32481-z

Forças Armadas na Célula Mantêm o DNA Saudável

Por David Coppedge | Evolution News
4 de outubro de 2022, 17h13

Repórteres científicos lutam por metáforas para descrever as operações complexas que eles veem acontecendo na célula. Por exemplo:

▪️ A Orquestra

Notícias da Universidade de Genebra comparam o genoma humano a uma “orquestra complexa”. Sua pesquisa levou a descobertas “inesperadas” e “surpreendentes” mostrando “comportamento harmonizado e sinérgico” na regulação dos genes. A metáfora de um maestro mantendo todos os vários jogadores em harmonia veio à mente:

Uma equipe de geneticistas suíços da Universidade de Genebra (UNIGE), da École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL) e da Universidade de Lausanne (UNIL) descobriu que a variação genética tem o potencial de afetar o estado do genoma em muitas posições aparentemente separadas e, assim, modular a atividade do gene, muito parecido com um maestro orientando os intérpretes de um conjunto musical para tocar com harmonia.

Esses resultados inesperados, publicados na Cell, revelam a versatilidade da regulação do genoma e oferecem insights sobre a forma como ela é orquestrada. [Enfase adicionada.]

▪️ As forças armadas

Outra metáfora popular entre os repórteres é “forças armadas”. Essa metáfora será instrutiva à medida que lemos sobre proteção do DNA e reparo de danos. Vejamos algumas das etapas desse processo onde encontraremos soldados, técnicos de emergência médica, ambulâncias e hospitais militares em ação, todos bem treinados e equipados para a defesa.

▪️ Vigilância e Inspeção

Qualquer operação militar disciplinada requer altos padrões.

Soldados no campo de treinamento sabem que os sargentos podem ser implacáveis ao inspecionar rifles, engraxates e camas de quartel.

Da mesma forma, as máquinas do genoma inspecionam o DNA em busca de erros e não toleram menos do que a perfeição.

Um artigo da Universidade Estadual da Carolina do Norte descreve a MutS, uma máquina que inspeciona fitas de DNA descompactadas em busca de erros.

Qualquer desencontro faz com que esse sargento pare e encare o recruta, mesmo que ele seja um em um milhão.

Felizmente, nossos corpos têm um sistema para detectar e reparar essas incompatibilidades – um par de proteínas conhecidas como MutS e MutL.

A MutS desliza ao longo do lado recém-criado da fita de DNA depois de replicada, revisando-a. Quando encontra uma incompatibilidade, ele se encaixa no local do erro e recruta a MutL para se juntar a ela.

A MutL faz um corte na fita de DNA recém-sintetizada para marcá-la como defeituosa e sinaliza uma proteína diferente para devorar a porção do DNA que contém o erro.

Em seguida, a correspondência de nucleotídeos recomeça, preenchendo a lacuna novamente. Todo o processo reduz os erros de replicação em cerca de mil vezes, servindo como melhor defesa contra mutações genéticas e os problemas que podem surgir delas, como o câncer.

▪️ Primeira resposta

Se ocorrerem vítimas, elas devem ser detectadas. Uma proteína chamada ATF3 é a capitã de um esquadrão que atua como “primeiro respondedor” a danos no DNA, como explica a Georgia Regents University.

Digamos que uma fita de DNA se rompa por causa da luz solar, quimioterapia ou um raio cósmico.

Se não for corrigida rapidamente, a célula pode se tornar cancerosa ou morrer. O que acontece primeiro?

No cenário rápido e complexo que permite que uma célula repare danos no DNA ou morra, a ATF3, ou Ativador do Fator de Transcrição 3, parece ser um verdadeiro primeiro respondedor, aumentando seus níveis e depois encontrando e se ligando a outra proteína, Tip60, o que acabará por ajudar atrair um enxame de outras proteínas para o local do dano.

▪️ Operações de Combate

Os vírus invadiram! As forças armadas entram em alerta máximo. O Salk Institute for Biological Studies descreve a enxurrada de atividades resultantes, porque todo organismo “deve proteger seu DNA a todo custo”.

Antes de entrar em pânico, os comandantes da célula precisam de inteligência. Se uma quebra de DNA coloca a célula em estresse, seja uma quebra natural, digamos de um raio cósmico, ou de um vírus, como um insurgente jogando uma granada? Um movimento em falso pode levar a baixas de fogo amigo.

Os pesquisadores explicam como a célula descobre se o dano ao DNA foi interno ou externo. Primeiro, o complexo MRN dá o sinal de “todas as mãos no convés”. Ele interrompe a replicação e outras operações da célula até que a quebra seja corrigida.

O interessante é que mesmo uma única interrupção transmite um sinal global através da célula, interrompendo a divisão e o crescimento celular”, diz O’Shea.

“Essa resposta impede a replicação para que a célula não passe por uma pausa .”

A resposta viral começa da mesma forma, mas não dá o alarme global.

Em vez disso, o alarme é localizado e sentinelas na área despacham os invasores. Há uma razão para isso.

“Se todos os vírus que chegam estimulassem uma resposta igualmente forte, aponta O’Shea, nossas células seriam pausadas com frequência, prejudicando nosso crescimento”. Mas quando a célula fica preocupada com o reparo de danos no DNA, os vírus podem se infiltrar.

Um vídeo no artigo aplica a metáfora das forças armadas:

Govind Shah: “As proteínas de reparo do DNA servem como guardas de segurança dentro do núcleo. Eles pegam o DNA do vírus e os escoltam para fora da célula.

Se uma célula sofrer uma grande quantidade de danos no DNA, esses guardas de segurança serão afastados do DNA viral e permitirão que o DNA viral se replique em altos níveis”.

Clodagh O’Shea: “Descobrimos que se você tem danos no DNA em seu próprio genoma, e o alarme dispara, na verdade isso recruta todas as forças: toda a polícia, guarda nacional – todo mundo está lá. Todas as forças estão lidando com seu próprio dano ao DNA, e não há mais nada para realmente ver ou desligar o vírus.”

Isso lhes deu uma ideia. Shah diz: “Então, por que não usar isso para matar células cancerígenas” com vírus projetados para entrar nas células tumorais? A resposta programada que eles descobriram fará com que a célula deixe os vírus entrarem enquanto está preocupada em consertar quebras de DNA.

“Se a célula não puder consertar a quebra do DNA, ela induzirá a morte celular – um mecanismo de autodestruição que ajuda a impedir que as células mutantes se repliquem (e, portanto, impede o crescimento do tumor)”.

▪️ Médicos

Estamos todos familiarizados com as imagens de helicópteros no campo de batalha entregando médicos para dar primeiros socorros aos feridos, ou transportando-os de avião para a estação de triagem ou hospital mais próximo. O núcleo da célula tem hospitais, diz um artigo da Biotechniques, e “ Uma ambulância molecular para DNA ” sabe como levar as vítimas ao pronto-socorro.

As quebras de fita dupla no DNA são uma fonte de estresse e às vezes a morte das células.

Mas as quebras podem ser corrigidas se encontrarem uma maneira de reparar os locais dentro da célula.

Em leveduras, um dos principais sítios de reparo reside no envelope nuclear, onde um conjunto de proteínas, incluindo o sub-complexo de poros nucleares Nup84, serve como uma espécie de hospital molecular.

O complexo de proteína motora cinesina-14, uma “ambulância de DNA”, move as pausas para locais de reparo, de acordo com um novo estudo da Nature Communications.

Pesquisadores da Universidade de Toronto acharam “muito surpreendente” que o motorista da ambulância seja a conhecida proteína motora cinesina-14 (veja nossa animação da cinesina em ação abaixo [áudio original em inglês]).

▪️ Funcionários do Hospital

Notícias do MD Anderson Cancer Center da Universidade do Texas apresentam alguns dos especialistas do hospital de reparo de DNA: fumarase, uma enzima metabólica; DNA-PK, uma proteína quinase; e enzimas de metilação de histonas que regulam o processo de reparo.

Esses médicos qualificados realizam cirurgias restauradoras para “quebras de fita dupla de DNA (DSBs)”, que “são a pior forma possível de mau funcionamento genético que pode causar câncer e resistência à terapia”.

▪️ Equipe de limpeza

As células investem muita energia em seus ribossomos, as organelas que traduzem o DNA. Os ribossomos são montados a partir de domínios de proteína e RNA. O que acontece com as sobras? Um item da Universidade de Heidelberg descreve máquinas moleculares que codificam os fragmentos em código de barras para serem entregues a um triturador em forma de barril chamado exossomo.

Embora não sejam descritos em termos militares, os agentes estão sob ordens estritas e obrigados a passar por postos de controle.

De acordo com o Prof. Hurt, a produção de ribossomos é um processo extremamente complexo que segue um esquema rígido com vários pontos de controle de qualidade .

As fábricas de proteínas são feitas de inúmeras proteínas ribossômicas (r-proteínas) e ácido ribonucleico ribossômico (rRNA).

Mais de 200 proteínas auxiliares, conhecidas como fatores de biogênese do ribossomo, são necessárias nas células eucarióticas para montar corretamente as proteínas-r e os diferentes rRNAs. Três do total de quatro rRNAs diferentes são fabricados a partir de um grande RNA precursor. Eles precisam ser “aparados” em pontos específicos durante o processo de fabricação, e as peças supérfluas são descartadas.

“Como esses processos são irreversíveis , é necessária uma verificação especial ”, explica Ed Hurt.

O número de pessoas das “forças armadas” envolvidas na defesa do DNA e no controle de qualidade das células é surpreendente. Está além de uma orquestra bem conduzida. É como uma operação militar, com protocolos rígidos, estrutura de comando hierárquica e especialistas treinados. Esses sistemas são orientados a objetivos: eles existem para proteger o genoma. Eles estão de plantão inspecionando componentes mesmo quando nada está errado. E quando as coisas dão errado, eles sabem exatamente o que fazer, como se estivessem bem treinados em seguir ordens.

Não estamos surpresos ao notar que esses artigos não dizem nada sobre evolução. Por quê? Porque todos sabemos pela nossa experiência que os fenómenos caracterizados por sistemas de comando e controle hierárquicos com procedimentos documentados e agentes qualificados são sempre concebidos de forma inteligente.

Este artigo foi publicado originalmente em 2015.

Sexta-feira Fóssil: Baleias Ambulantes E Por Que Todas As Críticas Ao Problema Do Tempo de Espera Falham

Por Günter Bechly | Evolution News
30 de setembro de 2022, 9h46

Esta sexta-feira dos fósseis apresenta os esqueletos reconstruídos de Pakicetus (abaixo) e Ambulocetus (acima), que são as chamadas “baleias ambulantes” do Eoceno do Paquistão.

Esses fósseis são frequentemente celebrados como elos perdidos e uma história de sucesso para o darwinismo. No entanto, eles de fato criam um problema fatal para o neodarwinismo, que é conhecido como o problema do tempo de espera.

O problema geral é que a janela de tempo estabelecida pelo registro fóssil para a transição de “baleias ambulantes” para baleias totalmente marinhas é muito curta para acomodar os tempos de espera para a origem e disseminação das mudanças genéticas necessárias, com base em a estrutura matemática padrão da genética de populações. Este problema foi elaborado de forma popular em várias publicações da comunidade do DI (Meyer 2013, Evolution News 2016, LeMaster 2018 ), e no documentário da Illustra Media Living Waters.

▪️ Um projeto de pesquisa multidisciplinar em andamento

O problema do tempo de espera é objeto de um projeto de pesquisa multidisciplinar em andamento financiado pelo Discovery Institute.

Já publicamos o trabalho de base teórica em dois artigos revisados por pares nos principais meios de comunicação (Hössjer et al. 2018, 2021). Uma aplicação sobre o exemplo das origens das baleias é apresentada por Bechly et al. (em preparação).

O problema do tempo de espera tem sido alvo de críticas desdenhosas por porta-vozes anti-DI (por exemplo, Moran 2016, Rasmussen 2021, Stern-Cardinale 2022, Farina 2022), que alegaram que é falacioso e não desafia o darwinismo.

Abordaremos essa crítica detalhadamente em nosso próximo artigo técnico, mas deixe-me aqui refutar brevemente os pontos principais para um público leigo, para que você esteja preparado para eventuais debates.

▪️ Revendo os pontos principais

1.) Os críticos muitas vezes sugerem explicitamente ou implicitamente que o problema do tempo de espera é um pseudoproblema inventado por criacionistas maus e estúpidos.

Este é um argumento tolo e embaraçosamente incompetente, que apenas mostra que esses críticos não apenas falharam em entender o problema, mas também parecem estar totalmente inconscientes de que o problema do tempo de espera tem uma longa história e tem sido muito discutido na ciência convencional (especialmente genética de populações). Ele ainda desempenha um papel importante na pesquisa do câncer.

Eles deveriam conversar com o professor de Harvard Martin Nowak, que é biólogo evolucionista e especialista no problema do tempo de espera. Aqui estão apenas algumas referências de cientistas renomados que publicam sobre essa “coisa maluca” como Farina (2022) a chama:

Bodmer (1970), Karlin (1973), Christiansen et al. (1998), Schweinsberg (2008), Durrett et al. (2009), Behrens et al. (2012) e Chatterjee et al. (2014).

Não foi antes de Behe & Snoke (2004, 2005) e Behe (2007, 2009) que o problema do tempo de espera foi reconhecido como argumento para o design inteligente. Durrett & Schmidt (2008) tentaram refutar Behe, mas chegaram a um tempo de espera proibitivo de 216 milhões de anos para uma única mutação coordenada na evolução humana, enquanto apenas cerca de 6 milhões de anos estão disponíveis desde a origem da linhagem humana de um ancestral comum com chimpanzés. Behe chegou às 10 15anos usando dados empíricos sobre um tempo de espera real para uma mutação coordenada que transmitiu resistência à droga cloroquina na malária.

Ele simplesmente transpôs essas descobertas empíricas em humanos, considerando seu tamanho populacional muito menor e tempo de geração muito maior. O resultado de Durrett & Schmidt foi baseado em um modelo matemático, que obviamente deve fazer algumas simplificações que podem introduzir erros. Quando tais cálculos de modelo entram em conflito com dados empíricos concretos, devemos confiar nos dados empíricos como se estivessem mais próximos da verdade. De qualquer forma, ambos os números são proibitivos e refutam a viabilidade de um mecanismo darwiniano de macroevolução.

2.) A maioria dos críticos considerou a objeção mais poderosa como sendo a “falácia do atirador de elite do Texas“. Eles alegaram que a natureza não busca mutações específicas como alvo, mas é totalmente aleatória. Esse argumento falha porque pressupõe a existência de muitos alvos, o que é contrariado pela raridade de função no espaço de busca de proteínas e pelo fenômeno comum de convergência.

O argumento também falha em reconhecer que a vida não pode permitir períodos de má adaptação apenas para descer um pico local da paisagem de aptidão para explorar outros. Em vez disso, a vida precisa se adaptar ainda mais ao seu pico de aptidão local, o que requer soluções específicas para problemas específicos. Não é como qualquer mutação benéfica poderia fazer. Uma baleia-tronco não teria utilidade para uma mutação que seria benéfica para uma ave-tronco, como melhorar a pneumática esquelética.

3.) Alguns críticos não entenderam o conceito de mutações coordenadas e até o chamaram de sem sentido.

Eles sugeriram que cada mutação individual pode ser selecionada. Isso mostra que eles não entenderam o ponto simples de que em mutações coordenadas cada mutação individual é neutra e, portanto, em princípio, não pode ser selecionada.

Apenas a combinação de mutações coordenadas tem um valor de seleção, que é o ponto principal, e a razão pela qual elas foram chamadas de “mutações coordenadas” em primeiro lugar.

4.) Alguns críticos afirmam que o problema do tempo de espera implica que as mutações devem ocorrer em uma sequência específica. Isso é simplesmente falso e talvez baseado em um mal-entendido do termo técnico “gene coordenado”. O fato é que nenhum proponente de DI jamais alegou que o problema do tempo de espera se aplica apenas a sequências particulares de mutações.

Para qualquer conjunto de parâmetros razoáveis, os tempos de espera para mutações coordenadas (ou seja, mutações que precisam ocorrer juntas para ter um valor de seleção) serão proibitivos, independentemente da ordem dessas mutações. O que é verdade é que o problema do tempo de espera fica ainda pior quando essas mutações também precisam ocorrer em uma sequência específica.

5.) Os críticos também alegaram que o problema do tempo de espera ignora a recombinação, que de acordo com Farina (2022) “desconta sem fundamento o profundo benefício evolutivo” e está “acelerando dramaticamente o acúmulo de mutações benéficas”. Isso mostra quão ignorantes são os críticos da literatura técnica atual, pois a influência da recombinação do problema do tempo de espera foi estudada por Christiansen et al. (1998), que mostraram que:

“A recombinação diminui o tempo de espera até que uma nova combinação genotípica apareça pela primeira vez, mas o efeito é pequeno [grifo meu] em comparação com a taxa de mutação e o tamanho da população”.

Em nossos artigos (Hössjer et al. 2018, 2021, Bechly et ai. na preparação) mostramos que a recombinação não afeta o tempo de espera sob suposições realistas para parâmetros como taxas de mutação e tamanhos de população.

6.) Os críticos também afirmam que o problema é meramente teórico, mas não realista em termos biológicos, por exemplo, porque não se aplica a exemplos concretos ou porque mutações coordenadas não são necessárias. Abordaremos esta última afirmação muito detalhadamente em nosso próximo artigo, onde aplicamos a estrutura teórica ao exemplo concreto das origens das baleias.

Também mostraremos, com base em dados evo-devo convencionais, que realmente são necessárias mutações coordenadas. Isso também é sugerido pelo fato de que mesmo caracteres simples como a cor da pele se mostraram altamente poligênicos, portanto controlados por muitos genes diferentes. A propósito: O problema do tempo de espera também foi aplicado ao exemplo concreto das origens humanas por Durrett & Schmidt (2008) e Sanford et al. (2015) com resultados proibitivos para a evolução darwiniana.

▪️ E finalmente

Por último, mas não menos importante, alguns críticos ficaram intrigados com a forma como os artigos dos proponentes do DI sobre o problema do tempo de espera poderiam de alguma forma chegar a periódicos revisados por pares, como o prestigioso Journal of Theoretical Biology. Bem, isso é fácil: porque é uma boa ciência revisada por pares e a censura usual da máfia darwinista às vezes falha em sabotar a publicação de pesquisas inconvenientes, mesmo que elas sempre se esforcem muito.

É o cúmulo da hipocrisia quando as mesmas pessoas se voltam e afirmam que os proponentes do DI não publicam suas coisas na literatura revisada por pares. Os darwinistas, como é bem conhecido, adoram jogar o jogo “Cara eu ganho, rabo você perde”.


Referências

  • Behrens S, Nicaud C & Nicodéme P 2012. An automaton approach for waiting times in DNA evolution. Journal of Computational Biology 19(5), 550–562. DOI: https://doi.org/10.1089/cmb.2011.0218
  • Behe MJ 2007. The Edge of Evolution. Free Press, New York (NY), 336 pp.
  • Behe M 2009. Waiting Longer for Two Mutations. Genetics 181(2), 819–820. DOI: https://doi.org/10.1534/genetics.108.098905
  • Behe MJ & Snoke DW 2004. Simulating evolution by gene duplication of protein features that require multiple amino acid residues. Protein Science 13(10), 2651–2664. DOI: https://doi.org/10.1110/ps.04802904
  • Behe MJ & Snoke DW 2005. A response to Michael Lynch. Protein Science 14(9), 2226–2227. DOI: https://doi.org/10.1110/ps.051674105
  • Bodmer WF 1970. The evolutionary significance of recombination in prokaryotes. Symposium of the Society for General Microbiology 20, 279–294.
  • Chatterjee K, Pavlogiannis A, Adlam B & Nowak MA 2014. The time scale of evolutionary innovation. PLoS Computional Biology 10(9):d1003818, 1–7. DOI: https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003818
  • Christiansen FB, Otto SP, Bergman A & Feldman MW 1998. Waiting with and without Recombination: The Time to Production of a Double Mutant. Theoretical Population Biology53(3), 199–215. DOI: https://doi.org/10.1006/tpbi.1997.1358
  • Durrett R & Schmidt D 2008. Waiting for two mutations: with applications to regulatory sequence evolution and the limits of Darwinian evolution. Genetics 180(3), 1501–1509. DOI: https://doi.org/10.1534/genetics.107.082610
  • Durrett R, Schmidt D & Schweinsberg J 2009. A waiting time problem arising from the study of multi-stage carcinogenesis. Annals of Applied Probability 19(2), 676–718. DOI: https://doi.org/10.1214/08-AAP559
  • Farina D 2022. Exposing the Discovery Institute Part 2: Stephen Meyer. Professor Dave Explains May 13, 2022. https://youtu.be/Akv0TZI985U
  • Hössjer O, Bechly G & Gauger A 2018. Phase-type distribution approximations of the waiting time until coordinated mutations get fixed in a population. Chapter 12, pp. 245–313 in: Silvestrov S, Malyarenko A & Rancic M (eds). Stochastic Processes and Algebraic Structures – From Theory Towards Applications. Volume 1: Stochastic Processes and Applications. Springer Proceedings in Mathematics and Statistics 271. DOI: 10.1007/978-3-030-02825-1_12
  • Hössjer O, Bechly G & Gauger A 2021. On the waiting time until coordinated mutations get fixed in regulatory sequences. Journal of Theoretical Biology 524:110657, 1–37. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2021.110657
  • Karlin S 1973. Sex and infinity: A mathematical analysis of the advantages and disadvantages of genetic recombination. pp. 155–194 in: Bartlett MS & Hiorns RW (eds). The Mathematical Theory of the Dynamics of Biological Populations. Academic Press, New York (NY), xii+347 pp.
  • LeMaster JC 2018. Evolution’s waiting-time problem and suggested ways to overcome it—A critical survey. BIO-Complexity 2018(2), 1–9. DOI: https://doi.org/10.5048/BIO-C.2018.2
  • Meyer SC 2013a. Darwin’s Doubt. HarperOne, New York (NY), viii+498 pp.
  • Moran L 2016. Targets, arrows, and the lottery fallacy. Sandwalk Jan. 14, 2016. https://sandwalk.blogspot.com/2016/01/targets-arrows-and-lottery-fallacy.html
  • Rasmussen MN 2021. Waiting Time Problem” and imaginary hurdles for evolution. Pandas Thumb June 12, 2021. https://pandasthumb.org/archives/2021/06/ID-and-imaginary-hurdles.html
  • Sanford J, Brewer W, Smith F & Baumgardner J 2015. The waiting time problem in a model hominin population. Theoretical Biology and Medical Modelling 12:18, 1–18. DOI: https://doi.org/10.1186/s12976-015-0016-z
  • Schweinsberg J 2008. The waiting time for m mutations. Electronic Journal of Probability13, 1442–1478. DOI: https://doi.org/10.1214/EJP.v13-540
  • Stern-Cardinale D 2022. Creation Myth: The “Waiting Time Problem” Creation MythsFebruary 15, 2022. https://youtu.be/F748itCI_es

A Deusa de Darwin: Seleção Natural Como “Substituto Divino”

Neil Thomas | Evolution News

Evolução Com e Sem Múltiplas Mudanças Simultâneas

William A. Dembski | Evolution News

Mais Sobre Máquinas Auto-Replicantes

Granville Sewell | Evolution News

27 de junho de 2022, 12hs39min

Em um post no início deste mês, descrevi Three Realities Chance Can’t Explain That Intelligent Design Can.

O post mostrou alguns dos problemas com explicações materialistas sobre como as quatro forças fundamentais e não inteligentes da física sozinhas poderiam ter reorganizado as partículas fundamentais da física na Terra em computadores, textos científicos e telefones inteligentes. Fiz uma comparação com máquinas auto-replicantes:

[Eu]imagino que de alguma forma conseguimos projetar, digamos, uma frota de carros com fábricas de construção de automóveis totalmente automatizadas, capazes de produzir carros novos – e não apenas carros novos normais, mas carros novos com fábricas de construção de automóveis totalmente automatizadas dentro deles. Quem poderia acreditar seriamente que, se deixássemos esses carros sozinhos por muito tempo, o acúmulo de erros de duplicação cometidos à medida que se reproduzissem resultaria em outra coisa que não a devolução e, eventualmente, poderia até ser organizado por forças seletivas em modelos de automóveis mais avançados?

▪️ Um olhar mais cuidadoso

Mas eu não acho que isso deixa suficientemente claro o quão difícil seria criar carros verdadeiramente auto-replicantes. Então vamos ver isso com mais cuidado. Sabemos como construir um carro Ford Modelo T simples. Agora vamos construir uma fábrica dentro deste carro, para que ele possa produzir carros Modelo T automaticamente.

Chamaremos o novo carro, com a fábrica do Modelo T dentro, de “Modelo U”.

Um carro com uma fábrica de automóveis inteira dentro, que nunca requer qualquer intervenção humana, está muito além da nossa tecnologia atual, mas não parece impossível que as gerações futuras possam construir um Modelo U.

É claro que os carros Modelo U não são auto-replicadores, porque eles só podem construir modelos T simples.

Então, vamos adicionar mais tecnologia a este carro para que ele possa construir o Modelo U, ou seja, o Modelo T com fábricas de construção de automóveis dentro. Este novo carro “Modelo V”, com uma fábrica totalmente automatizada no interior capaz de produzir os Modelos U (que estão muito além da nossa tecnologia atual), seria inimaginavelmente complexo.

Mas este novo Model V agora é um auto-replicador? Não, porque apenas constrói o Modelo U muito mais simples. As espécies do Modelo V serão extintas após duas gerações, porque seus filhos serão Modelo U e seus netos serão Modelo T inférteis!

▪️ Então de volta ao trabalho

Cada vez que adicionamos tecnologia a esse carro, para aproximá-lo da meta de reprodução, apenas movemos as traves, porque agora temos um carro mais complicado de reproduzir.

Parece que os novos modelos cresceriam exponencialmente em complexidade, e começamos a nos perguntar se é mesmo teoricamente possível criar máquinas auto-replicantes.

No entanto, vemos essas máquinas ao nosso redor no mundo dos vivos. Você e eu somos dois exemplos. E aqui ignoramos a questão muito difícil de onde esses carros obtêm os metais, a borracha e outras matérias-primas de que precisam para abastecer suas fábricas.

É claro que os materialistas dirão que a evolução não criou diretamente máquinas auto-replicantes avançadas.

Em vez disso, levou apenas um primeiro auto-replicador simples e gradualmente evoluiu para auto-replicadores cada vez mais avançados.

Mas, além do fato de que os engenheiros humanos ainda não têm ideia de como criar qualquer máquina auto-replicante “simples”, o ponto é que os evolucionistas estão atribuindo a causas naturais a capacidade de criar coisas muito mais avançadas do que carros auto-replicantes (por exemplo, humanos auto-replicantes), que parecem impossíveis, ou virtualmente impossíveis, de projetar.

Eu admiti em meu post anterior (e em meu vídeo A Summary of the Evidence for Intelligent Design ”) que engenheiros humanos podem algum dia construir uma máquina auto-replicante. Mas mesmo que o façam, isso não mostrará que a vida poderia ter surgido por meio de processos naturais. Só terá mostrado que poderia ter surgido através do design.

▪️ Design por erros de duplicação

De qualquer forma, como escrevi lá, mesmo que pudéssemos criar carros auto-replicantes, quem poderia acreditar seriamente que os erros de duplicação cometidos à medida que se reproduziam poderiam levar a grandes avanços? (E até mesmo máquinas inteligentes e conscientes eventualmente.) Certamente uma máquina inimaginavelmente complexa como um carro auto-replicante só poderia ser danificada por tais erros, mesmo quando filtrada pela seleção natural.

Estamos tão acostumados a ver animais e plantas se reproduzirem com degradação mínima de geração em geração que não percebemos o quão surpreendente isso realmente é.

Nós realmente não temos ideia de como os seres vivos são capazes de passar suas atuais estruturas complexas para seus descendentes, muito menos como eles poderiam evoluir estruturas ainda mais complexas.

Quando os matemáticos têm uma prova simples e clara de um teorema e um contra-argumento longo e complicado, cheio de suposições não comprovadas e argumentos questionáveis, aceitamos a prova simples, mesmo antes de encontrarmos os erros no contra-argumento complicado.

O argumento para o design inteligente não poderia ser mais simples ou mais claro: forças não inteligentes sozinhas não podem reorganizar átomos em computadores e aviões e usinas nucleares e telefones inteligentes, e qualquer tentativa de explicar como isso pode falhar em algum lugar porque obviamente não pode.

Como muitos cientistas não ficam impressionados com argumentos tão simples, meu post foi uma tentativa de apontar alguns dos erros na explicação de três etapas do materialista sobre como eles poderiam. E dizer que todas as três etapas estão cheias de suposições não comprovadas e argumentos questionáveis é um eufemismo.

No mínimo, deve ficar claro agora que, embora a ciência possa explicar tudo o que aconteceu em outros planetas apelando apenas para as forças não inteligentes da natureza, tentar explicar a origem e a evolução da vida na Terra é uma tarefa muito mais difícil e o design inteligente deve pelo menos ser contado entre as opiniões que podem ser ouvidas.

De fato, isso já está começando a acontecer.

Estudo Desafia Teoria Evolucionista De Que Mutações No DNA São Aleatórias

Por Science Daily
12 de janeiro de 2022

Uma simples erva daninha numa estrada pode ser a chave para entender e prever a mutação do DNA, de acordo com uma nova pesquisa da Universidade da Califórnia, Davis, e do Instituto Max Planck de Biologia do Desenvolvimento, na Alemanha.

As descobertas, publicadas em 12 de janeiro na revista Nature, mudam radicalmente nossa compreensão da evolução e podem um dia ajudar os pesquisadores a produzir melhores colheitas ou até mesmo ajudar os humanos a combater o câncer.

As mutações ocorrem quando o DNA é danificado e não é reparado, criando uma nova variação. Os cientistas queriam saber se a mutação era puramente aleatória ou algo mais profundo. O que encontraram foi inesperado.

“Sempre pensamos na mutação como basicamente aleatória em todo o genoma”, disse Gray Monroe, professor assistente do Departamento de Ciências Vegetais da UC Davis, principal autor do artigo. “Acontece que a mutação é muito não-aleatória e é não aleatória de uma forma que beneficia a planta. É uma maneira totalmente nova de pensar sobre a mutação.”

Os pesquisadores passaram três anos sequenciando o DNA de centenas de Arabidopsis thaliana , ou agrião thale, uma pequena erva daninha florida considerada o “rato de laboratório entre as plantas” por causa de seu genoma relativamente pequeno, composto por cerca de 120 milhões de pares de bases. Os humanos, em comparação, têm cerca de 3 bilhões de pares de bases.

“É um organismo modelo para a genética”, disse Monroe.

▪️ Plantas cultivadas em laboratório produzem muitas variações

O trabalho começou no Instituto Max Planck, onde os pesquisadores cultivaram espécimes em um ambiente de laboratório protegido, o que permitiu que plantas com defeitos que podem não ter sobrevivido na natureza pudessem sobreviver em um espaço controlado.

O sequenciamento dessas centenas de plantas Arabidopsis thaliana revelou mais de 1 milhão de mutações. Dentro dessas mutações foi revelado um padrão não aleatório, contrário ao que se esperava.

“À primeira vista, o que descobrimos parecia contradizer a teoria estabelecida de que as mutações iniciais são totalmente aleatórias e que apenas a seleção natural determina quais mutações são observadas nos organismos”, disse Detlef Weigel, diretor científico do Instituto Max Planck e autor sênior do estudo.

Em vez de aleatoriedade, eles encontraram trechos do genoma com baixas taxas de mutação. Nessas manchas, eles ficaram surpresos ao descobrir uma representação exagerada de genes essenciais, como os envolvidos no crescimento celular e na expressão gênica.

Estas são as regiões realmente importantes do genoma”, disse Monroe. “As áreas que são biologicamente mais importantes são as que estão protegidas contra mutações.”

As áreas também são sensíveis aos efeitos nocivos de novas mutações. “O reparo de danos ao DNA parece, portanto, ser particularmente eficaz nessas regiões”, acrescentou Weigel.

▪️ Planta evoluiu para se proteger

Os cientistas descobriram que a forma como o DNA estava envolvido em diferentes tipos de proteínas era um bom preditor de se um gene sofreria mutação ou não. “Isso significa que podemos prever quais genes são mais propensos a sofrer mutações do que outros e nos dá uma boa ideia do que está acontecendo”, disse Weigel.

As descobertas adicionam uma reviravolta surpreendente à teoria da evolução por seleção natural de Charles Darwin porque revela que a planta evoluiu para proteger [Oi? Hã? Teleologia???] seus genes de mutações para garantir a sobrevivência.

“A planta desenvolveu uma maneira de proteger [😒] seus lugares mais importantes da mutação”, disse Weigel. “Isso é empolgante porque podemos até usar essas descobertas para pensar em como proteger os genes humanos da mutação”.

▪️ Usos futuros

Saber por que algumas regiões do genoma sofrem mais mutações do que outras pode ajudar os criadores que dependem da variação genética para desenvolver colheitas melhores. Os cientistas também podem usar as informações para prever melhor ou desenvolver novos tratamentos para doenças como o câncer, causadas por mutação.

“Nossas descobertas fornecem um relato mais completo das forças que impulsionam os padrões de variação natural; elas devem inspirar novos caminhos de pesquisa teórica e prática sobre o papel da mutação na evolução”, conclui o artigo.

Os co-autores da UC Davis incluem Daniel Kliebenstein, Mariele Lensink, Marie Klein, do Departamento de Ciências das Plantas. Pesquisadores da Carnegie Institution for Science, Stanford University, Westfield State University, University of Montpellier, Uppsala University, College of Charleston e South Dakota State University contribuíram para a pesquisa.

O financiamento veio da Max Planck Society, da National Science Foundation e da German Research Foundation.


[Ênfase adicionada. E a imagem é do Evolution News que cita esse artigo do Science Daily]


Referência do jornal:

  1. J. Grey Monroe, Thanvi Srikant, Pablo Carbonell-Bejerano, Claude Becker, Mariele Lensink, Moises Exposito-Alonso, Marie Klein, Julia Hildebrandt, Manuela Neumann, Daniel Kliebenstein, Mao-Lun Weng, Eric Imbert, Jon Ågren, Matthew T. Rutter, Charles B. Fenster, Detlef Weigel. Mutation bias reflects natural selection in Arabidopsis thaliana. Nature, 2022; DOI: 10.1038/s41586-021-04269-6


Comentário do blog:

Percebem a linguagem teleológica? E percebem que mesmo um modelo fundamental não serve para descartar o modelo evolucionista na sua natureza materialista, não guiada, sem objetivos, enfim, não teleológica? Isso ocorre porque esse modelo não se submete mais a critérios científicos mas se trata de uma espécie de religião secular, um dogma, uma ideologia, não havendo dados brutos que a refute, enfim, a TE é na prática aquilo que ela acusa a TDI de ser: uma pseudociência moderna.

Cientistas Da NYU Confundem Seleção Artificial Com Darwinismo

Por Evolution News | DiscoveryCSC
7 de janeiro de 2022, 6h14

É cansativo continuar corrigindo o mau uso dos termos pelos evolucionistas. A seleção artificial é o oposto da seleção natural. Não se deve confundir os dois. A diferença deveria ser evidente, mas de alguma forma não é.

Considere um artigo de quatro químicos e físicos da Universidade de Nova York, “Mutações em telhas artificiais auto-replicantes: um passo em direção à evolução darwiniana” (Zhou, Sha et al., PNAS).

Na natureza, a mutação é a primeira etapa da evolução, onde fornece a variação genética para a ação da seleção natural.

Aqui, pegamos um sistema de ladrilhos artificiais que se auto-replicam, origami de DNA, que exibem reprodução modelada. Podemos gerar uma pequena fração de mutações, introduzindo uma incompatibilidade na hibridação entre pai e filha. Podemos modificar a funcionalidade do origami para afetar a taxa de crescimento das espécies mutantes, dando-lhe menos ou mais vantagem evolutiva, e se tornar dominante em várias gerações. A introdução de mutações em um sistema artificial auto-replicante fornece novas direções para pesquisas em processos de auto-montagem.
[Ênfase adicionada.]

Este não é “um passo em direção à evolução darwiniana”. É um passo na direção oposta. Se eles realmente quisessem dar um passo em direção à evolução darwiniana, eles sairiam do laboratório e deixariam acontecer qualquer coisa. O que vai acontecer é um aumento da entropia.

▪️ O erro de interferência

Em The Mystery of Life’s Origin (veja a edição expandida, publicada em 2020 ), Thaxton, Bradley e Olsen enfatizam o erro da interferência do investigador em experimentos de origem da vida. Quando Zhou et al. digamos, “Aqui nós introduzimos vantagens de mutação e crescimento para estudar a possibilidade de uma evolução parecida com a de Darwin”, elas revelam um mal-entendido fundamental do Darwinismo. Chamar seu trabalho de “evolução de tipo darwiniana” quando eles estão puxando os cordões é uma contradição em termos.

Em uma tentativa de ser caridoso, vamos ver se eles entendem a natureza contraditória de sua afirmação em qualquer parte do jornal. O parágrafo final resume sua pesquisa:

Desenvolvemos um sistema artificial de peças de origami de DNA de duas espécies em que podemos controlar as taxas de crescimento separadamente.

Adicionando a capacidade de uma espécie de se transformar em outra, estudamos a evolução do sistema em que apenas uma espécie é semeada. Quando as taxas de crescimento são iguais, o sistema evolui para um estado estacionário de populações iguais.

Quando se tem a vantagem competitiva de um crescimento mais rápido, ele rapidamente se torna a espécie dominante, mesmo quando resulta apenas de uma mutação da espécie originalmente semeada e de crescimento exponencial.

Este é o resultado esperado e um exemplo mais elementar da evolução darwiniana, mas aqui em um sistema de auto-replicação artificial.

Infelizmente, a contradição permanece.

▪️ As simulações são inúteis?

Isso não quer dizer que os experimentos com seleção artificial não tenham valor educacional. Esses experimentos, como a simulação de computador Avida (discutida aqui e aqui ), serviram a um propósito ao mostrar os limites da aleatoriedade. Podem ser apontados casos de interferência do investigador, para falsificar afirmações impetuosas de que uma simulação mal concebida representa uma evolução “semelhante a darwiniana”. De fato, alguns defensores do design criaram suas próprias simulações de computador para ilustrar as limitações do mecanismo de mutação / seleção quando parâmetros mais realistas são especificados.

Algoritmos evolutivos também podem levar a resultados científicos com valor prático. Zhou et al. especulam sobre o que outras pesquisas com seus “blocos de DNA” em evolução podem trazer:

Ele abre a porta para o uso de sistemas, dispositivos e materiais feitos pelo homem que evoluem para ter as propriedades desejadas.

Em um determinado ambiente, as mutações permitem a criação de um conjunto de espécies e a evolução escolhe as espécies que mais crescem naquele ambiente, imitando a natureza, mas com construções artificiais.

Se algo útil sair desses experimentos, muito bem – mas não será por causa do darwinismo. Quem faz os “sistemas, dispositivos e materiais” que evoluem? Quem decide o que são “propriedades desejadas”? Quem define as “construções artificiais” que geram produtos potencialmente úteis? Claramente, designers humanos estão fazendo tudo isso.

Eles definem a taxa de mutação e monitoram os resultados para escolher vencedores e perdedores. A evolução não “escolhe a espécie” que cresce mais rápido; os designers fazem isso decidindo com antecedência quais serão as propriedades desejadas e ajustando as configurações para obter o rendimento mais alto.

Empregar o acaso como ferramenta não anula o DI. Na maioria dos jogos de cartas, o baralho é embaralhado primeiro. Os jogadores não sabem que cartas vão aparecer em suas mãos, mas conhecem as regras do jogo e aprendem estratégias para vencer. Em um processo de seleção artificial que faz uso de variações aleatórias, o darwinismo para quando uma mente inteligente interfere e faz a seleção.

Aqui, relatamos o estudo da mutação e evolução de um sistema de auto-replicação artificial de jangadas de dímero de origami de DNA. Isso representa um primeiro passo em direção ao uso de tais mutações em direção à evolução direcionada de um sistema artificial e ilustra alguns dos princípios básicos da seleção natural.

Nós concebemos duas espécies auto-replicantes AB e CD, que partilham o mesmo procedimento de replicação, mas com uma controlável taxa de crescimento ….

▪️ Valor duvidoso

Quando os autores começaram e terminaram com premissas erradas, quaisquer conclusões serão duvidosas. Veja como eles projetaram as espécies auto-replicantes. Veja como eles direcionaram a evolução.

Veja como eles chamam de sistema artificial. Eles definem os procedimentos. Eles controlaram os parâmetros. Com base em que eles podem dizer que seu trabalho “ilustra alguns dos princípios básicos da seleção natural”? Não há nada de natural nisso. Eles foram os seletores do início ao fim. Na verdade, eles admitem que a aleatoriedade pura levaria à catástrofe do erro sem a interferência contínua do investigador.

A mutação e o domínio da população pelas espécies mais aptas equivaleriam à seleção natural neste sistema artificial. [???]

Visando usar este processo para evolução direcionada e o fato de que uma alta taxa de mutação leva a uma catástrofe de Eigen, ou uma espécie não persiste por tempo suficiente para tirar vantagem de sua vantagem evolutiva, mantivemos a mutação numa taxa baixa, embora ainda não tão baixa quanto nos sistemas vivos.

No caso presente, uma taxa de mutação baixa é particularmente importante, pois as mutações direta e reversa estão igualmente limitando a proporção final das espécies com alta e baixa vantagem de crescimento.

É preciso rir de frases como “seleção natural neste sistema artificial” e intervenções como definir uma taxa de mutação baixa para evitar a catástrofe de Eigen.

Se você está controlando as mutações e selecionando os resultados, não está praticando o darwinismo. Críticas como essa têm sido feitas contra os discípulos de Darwin por mais de um século, mas elas caem em ouvidos surdos. Por que a mensagem não está chegando?

A Descontinuidade do Registro Fóssil Refuta o Gradualismo do Darwinismo

Por Günter Bechly | Evolution News
2 de novembro de 2021, 6h19

Nota do editor: este artigo é um trecho de um capítulo do livro The Comprehensive Guide to Science and Faith: Exploring the Ultimate Questions About Life and the Cosmos.

Cada teoria faz certas previsões.

A previsão central da teoria da evolução de Darwin é o gradualismo, o que significa que todas as mudanças transicionais na história da vida não devem ter acontecido como grandes mudanças repentinas, mas por um acúmulo contínuo de pequenas mudanças ao longo de vastos períodos de tempo. A simples razão é que Darwin queria uma explicação naturalista e estava totalmente ciente de que grandes mudanças repentinas de organismos exigiriam eventos milagrosos. Por isso, mencionou não menos que seis vezes em sua magnum opus sobre a Origem das Espécies a frase latina Natura non facit saltus, que significa que a natureza não dá saltos.

▪️Se o gradualismo estiver errado

Essa afirmação ainda é feita por darwinistas hoje. O mais conhecido popularizador moderno do darwinismo, o infame ateu Richard Dawkins, escreveu em seu livro best-seller de 2009 The Greatest Show on Earth a seguinte declaração notável:

“A evolução não é apenas um processo gradual como uma questão de fato; tem que ser gradual se for para fazer qualquer trabalho explicativo.”

Isso mostra que o gradualismo não é apenas um elemento opcional do darwinismo, mas que é muito essencial para seu sucesso como uma explicação naturalista para a complexidade e diversidade da vida. Se o gradualismo estiver errado, então o darwinismo é refutado.

Na verdade, o registro fóssil é altamente descontínuo e contradiz fortemente a previsão de gradualismo de Darwin. Até o próprio Darwin estava bastante ciente desse problema para sua teoria e, portanto, tentou explicá-lo como um mero artefato de subamostragem de um registro fóssil muito incompleto. O famoso paleontólogo vertebrado Philip Gingerich certa vez observou com irritação que “lacunas de evidência são lacunas de evidência e não evidência de lacunas”.

▪️Passeios na praia

No entanto, tais apelos à incompletude do registro fóssil não são mais sustentáveis. O teórico do design inteligente e filósofo da ciência Paul Nelson explicou convincentemente por quê:

Imagine que você tem um novo hobby, limpar a praia. Todos os dias você caminha ao longo da costa e coleta o que a maré traz. No começo você é surpreendido a cada dia por novas descobertas – conchas de novos tipos de caracóis e mexilhões, estrelas do mar, dólares de areia e troncos, etc. Mas depois de um tempo você está encontrando basicamente as mesmas coisas repetidas vezes e deve ter a sorte de encontrar algo novo que não tenha visto antes (como uma baleia encalhada ou uma mensagem em uma garrafa).

Quando você atinge esse ponto de maior repetição, sabe que já colheu amostras suficientes para ter certeza de que não perdeu muito do que há para se descobrir.

A mesma abordagem é usada por paleontólogos para um teste estatístico da integridade do registro fóssil; é chamada de curva do coletor.

Na maioria dos grupos de fósseis, chegamos a este ponto de saturação demonstrável, onde podemos estar bastante confiantes de que as distintas descontinuidades que encontramos são dados a serem explicados e não apenas amostragem de artefatos.

Há outra razão pela qual sabemos disso: se as lacunas e descontinuidades no registro fóssil fossem apenas artefatos, elas deveriam se dissolver cada vez mais com nosso conhecimento cada vez maior do registro fóssil.

Mas o caso é oposto. Quanto mais sabemos, mais agudos esses problemas se tornam. A “dúvida de Darwin” não ficou menor com o tempo, mas maior, e se ele ainda estivesse vivo, provavelmente concordaria que as evidências simplesmente não batem, já que ele era muito mais prudente do que muitos de seus seguidores modernos.

▪️Uma escala de tempo apropriada

Claro, temos que considerar a escala de tempo apropriada na história da Terra para estimar se algum evento na história da vida é abrupto ou não.

Na história da humanidade, não consideraríamos um evento que dura muitos anos (digamos, décadas ou um século) como abrupto. Mas em termos biológicos ou geológicos, o aparecimento de um novo grupo de organismos com um novo plano corporal dentro de, digamos, uma janela de tempo de 5 a 10 milhões de anos é de fato muito abrupto.

Porque isto é assim? Porque a longevidade média de uma espécie de invertebrado ou vertebrados (não de um organismo individual) varia entre 2,5 a 10 milhões de anos. Isso significa que uma transição que levou de 5 a 10 milhões de anos aconteceu durante a vida de uma única espécie! Isso é muito curto para permitir que a evolução darwiniana explique as mudanças necessárias.


[Obs: texto e título adaptados]

Artigo Científico Sobre Elementos Repetitivos Critica O “DNA Lixo”

Por Casey Luskin | Evolution News


Quando me envolvi pela primeira vez com o debate sobre design inteligente no final dos anos 1990 e no início dos anos 2000, uma das refutações mais comuns que ouvíamos era:

“Se a vida foi projetada, então por que mais de 90% do genoma é composto de DNA lixo?” 

Os críticos pensaram que isso era uma refutação completa do DI e usaram o argumento com frequência. Mas isso foi nos primeiros dias do sequenciamento do genoma, e muito pouco se sabia na época sobre o DNA não codificador e se era realmente lixo ou tinha funções úteis e importantes. 

Muitos pensadores do movimento DI acharam que seria imprudente admitir que a maior parte do genoma era lixo quando a ciência ainda não havia estabelecido que esse era de fato o caso. Nossa resposta foi, portanto, “nós realmente não sabemos o que a maior parte do genoma está fazendo. É melhor adotar uma abordagem de esperar para ver. Vamos descobrir para onde vai a pesquisa no futuro antes de concluirmos que o genoma é principalmente lixo.” É incrível ver como as coisas mudaram desde aquela época. 

O estado da pesquisa


Considere o estado da pesquisa hoje, cerca de 20 anos depois. 

Conforme observado brevemente ontem pelo Evolution News, um novo artigo na revista Genome Biology and Evolution  Satellite-Like W-Elements: Repetitive, Transcribed, and Putative Mobile Genetic Factors with Potential Roles for Biology and Evolution of Schistosoma mansoni – contém impressionantes linguagem que documenta o pensamento atual sobre o DNA-lixo e como esse pensamento mudou ao longo do tempo. O artigo começa observando o quão prevalente é o DNA não codificador: 

Uma grande parte dos genomas de animais e plantas consiste em DNA não codificador. Esta parte inclui sequências repetidas em tandem e ganhou atenção porque oferece ideias interessantes sobre a biologia do genoma. 


Os autores estudaram o verme do filo platelmintoSchistosoma mansoni, e observaram o DNA repetitivo no cromossomo W feminino. Eles investigaram elementos repetitivos no cromossomo W, chamados WEs, e identificaram 19 famílias diferentes de WEs, chamados WEFs.

Apenas tive sorte?


À parte, estou vagamente familiarizado com esse tipo de verme, já que esses parasitas causam bilharzia, uma doença comum e desagradável, mas tratável, que se pode contrair no sul da África depois de passar muito tempo na água parada. 

Durante meus estudos de doutorado na África do Sul, passei muito tempo – quero dizer  muito – caminhando com dificuldade através de rios, muitas vezes perfurando afloramentos rochosos e coletando enquanto estava de pé na água até os joelhos. Sempre tive o cuidado de fazer isso apenas na água em movimento, onde parasitas do gênero Schistosoma, me disseram, não seriam um problema. Ou tive sorte ou fiz alguma coisa certa porque nunca contraí bilharzia. 

Em qualquer caso, o artigo previu que esses WEs são funcionais, pois eles “desafiam a visão clássica de que o DNA repetitivo nos cromossomos sexuais é simplesmente um subproduto da heterocromatização e fornecem mais evidências de sua importância funcional”. 

Eles descobriram que esses WEFs codificam RNAs não codificantes (ncRNAs) e estão envolvidos na determinação do sexo no Schistosoma. Depois de analisar extensas evidências de função nesses WEFs, eles oferecem uma descoberta surpreendente:

Os dias de “DNA lixo” acabaram. Quando os autores seniores deste artigo estudaram genética em suas respectivas universidades, a doutrina comum era que a parte codificadora não proteica dos genomas eucarióticos consiste em sequências intercaladas “inúteis”, muitas vezes organizadas em elementos repetitivos como o satDNA. Este último pode ter se acumulado durante a evolução, por exemplo, como consequência de eventos de duplicação de genes para separar e individualizar a função do gene. Essa visão mudou fundamentalmente, e nosso estudo é o primeiro a abordar essa questão com aspectos estruturais, funcionais e evolutivos para o genoma de um parasita multicelular… Aqui, fornecemos evidências conclusivas para a expressão de WEF ao longo do desenvolvimento do esquistossomo, do miracídio aos estágios adultos.

[…]

A partir dos dados obtidos em nosso estudo e contra o pano de fundo da literatura recente, é tentador especular que mais do “DNA-lixo” do WE pode ser funcional e relevante mais do que o esperado. WEs de todos os WEFs investigados exibem uma incidência caprichosa, e são transcritos em um estágio, sexo, pareamento, gônada e padrão específico de cepa ou preferencial. 

A partir de descobertas exemplares de características típicas da atividade de elementos genéticos móveis, formulamos a hipótese de que WEs podem ter um caráter móvel. Junto com achados anteriores de eventos de recombinação intraclonal de WEs, seu papel presuntivo na emergência de cromossomos sexuais, sua capacidade putativa de expressar RNAs reguladores, propomos que WEs podem influenciar a biologia de S. mansoni. 

Além disso, com base na ocorrência variável de WEFs em diferentes cepas de esquistossomos, isolados e até mesmo espécies, nossa hipótese é que os WEs representam uma das fontes de variabilidade hereditária na evolução da família Schistosomatidae. [Ênfase adicionada; citações internas removidas.]


Antigamente


O que é surpreendente sobre esta passagem não é apenas que a evidência da função no DNA lixo é tão avassaladora que eles declaram “Os dias do ‘DNA lixo’ acabaram”, mas também que esses autores se lembram de um dia em que “a doutrina comum era que o parte codificadora não proteica do genoma eucariótico “consistia em” sequências ‘inúteis’, muitas vezes organizadas em elementos repetitivos “. 

Eu também me lembro daqueles dias. Quando comecei o primeiro IDEA Club na UC San Diego, éramos constantemente atingidos na cabeça por aquela “doutrina comum” de que o DNA não codificado era lixo, e nos disseram que isso refutava o design inteligente. Mas os autores continuam, dizendo que “essa visão mudou fundamentalmente”. 

Não vejo evidências de que esses autores apóiem o design inteligente. Mas acontece que nós, proponentes do DI, estávamos certos o tempo todo em encorajar os críticos a adotar uma abordagem cautelosa de “esperar para ver” e deixar que as evidências, em vez da “doutrina” evolucionista, determinassem qual paradigma estava correto. 

Distanciar Darwin do racismo é uma missão tola

Michael Flannery | Evolution News

O Gênio De Darwin: A Seleção Natural Mal Aplicada Continua

Por Evolution News | DiscoveryCSC
6 de julho de 2021, 6h23

Muitos se lembram da piada sobre a melhor maneira de abrir uma lata: “Suponha que seja um abridor de latas”. Ou a piada sobre o que sustenta a Terra, se a Terra é sustentada por uma tartaruga: “São tartarugas até o fundo”. Rimos dessas explicações vazias, mas o darwinismo não é assim? É uma explicação abrangente para tudo. Apenas assuma, e isso explicará todos os dados. Darwin pode ter definido em termos da origem das espécies, mas hoje, a seleção natural é o canivete suíço aplicado em campos amplamente divergentes. Pode ser usado como abridor de latas, saca-rolhas, raspador, chave de fenda e até mesmo uma adaga para se defender dos críticos. Simplesmente assuma que este abridor de latas está pronto e o trabalho explicativo está concluído. Se não, há mais canivetes suíços em todo o caminho.

Artigos sérios usaram a seleção natural para explicar a resistência bacteriana aos antibióticos, a política humana e o multiverso. Qualquer fenômeno que sofra mudanças, mas sobreviva, parece um jogo justo para apresentar a ferramenta de bolso explicativa multifacetada de Darwin.

Dito de outra forma, é como um demônio. O demônio de Maxwell era um experimento mental sobre uma possível maneira de violar uma lei natural; ainda hoje, os físicos discutem sobre maneiras de testá-lo.

A seleção natural é outra força oculta, completa com “pressões de seleção” místicas que podem criar olhos e asas por acaso. Esse demônio também possibilita violações de uma lei natural: a lei de causa e efeito. A seleção natural poderia ser chamada de “demônio de Darwin” ou, como o demônio gosta de se retratar, o gênio de Darwin. Ele vai cumprir todos os desejos de seu mestre.

Erros Históricos

Os críticos da Origem das Espécies imediatamente atacaram a falaciosa analogia de Darwin da reprodução seletiva com sua nova noção de seleção natural. O primeiro é feito por pessoas com mentes agindo com visão em direção a um objetivo, eles apontaram; o último é considerado cego e não guiado. No entanto, os discípulos de Darwin, desde então, brincaram de maneira rápida e solta com a seleção natural, aplicando-a em situações às quais ela não pertence, sem levar em conta qualquer inteligência humana envolvida.

Um exemplo recente apareceu em uma edição especial do PNAS sobre economia. Em seu artigo introdutório à série, Simon A. Levin e Andrew W. Lo elogiam Darwin ao repetir seu erro de raciocínio analógico falho.

Motivamos esta iniciativa ambiciosa com uma analogia.

Os brilhantes insights evolutivos de Darwin e outros revolucionaram nossa compreensão do mundo. Darwin ficou impressionado com o “banco emaranhado” de formas elaboradas que emergiram dos processos não direcionados da evolução para produzir a complexidade do mundo biológico.

Por meio da inovação contínua combinada com o filtro aparentemente simples conhecido como seleção natural, as características das espécies e suas interações mudam em resposta às mudanças dos ambientes. No entanto, a evolução não se limita apenas ao mundo biológico. Onde quer que existam as forças evolutivas de reprodução, variação e seleção – como ocorre nos mercados financeiros – as consequências evolutivas ocorrerão. [Enfase adicionada.]

Sob o ônibus

Não importa os comerciantes, inovadores e teóricos da ciência econômica. Eles foram jogados sob o ônibus. É a seleção natural até o fim. A escolha inteligente por pessoas qualificadas com livre arbítrio, respondendo tão sabiamente quanto possível às rápidas mudanças nas condições do mercado, é coisa velha.

O empreendedorismo acabou. A teoria econômica de professores efetivos como Thomas Sowell se foi. Tudo agora é o demônio de Darwin em ação, trazendo esclarecimentos sobre a verdadeira natureza da economia. As pessoas são apenas peões de pressões de seleção. A economia agora é como jangadas em corredeiras sem pilotos. Os mais sortudos sobreviverão e o gênio sorrirá com um trabalho explicativo bem executado.

A evolução diz respeito à otimização relativa de curto prazo em relação a outros participantes do sistema. Na biosfera, a seleção natural atua para melhorar o sucesso reprodutivo em relação ao benchmark de outros genomas, dentro e entre as espécies.

A mudança evolutiva pode, portanto, ser pensada em termos de aptidão diferencial: isto é, pequenas diferenças nas taxas reprodutivas entre os indivíduos ao longo do tempo, levando a grandes diferenças nas populações. Mesmo os próprios mecanismos de evolução – incluindo aqueles que geram novas variações – estão sujeitos a modificações constantes. No mundo financeiro, as forças evolutivas de mutação, recombinação, reprodução e seleção muitas vezes atuam nas instituições financeiras e nos participantes do mercado por meio da competição direta, finanças “vermelhas com os dentes e as garras”. Assim, os conceitos e estratégias financeiras se reproduzem por meio da transmissão e adoção cultural com base em seu sucesso no mercado.

Essas estratégias sofrem variação por meio da inovação financeira, análoga à mutação ou recombinação genética em um sistema biológico, mas ocorrem no nível da informação e do pensamento abstrato em contextos financeiros. É a “sobrevivência dos mais ricos”.

Se a própria evolução evolui, não precisamos de pessoas nesta imagem. Basta “forças evolutivas” empurrando os objetos, sejam eles moléculas, células, organismos, homens ou universos.

Nenhuma inteligência permitida

Os outros artigos da série repetem o erro. Seus autores invocam o gênio de Darwin para criar a aparência de uma explicação científica para os empreendimentos humanos.

Em “Sunsetting como uma estratégia adaptativa”, Roberta Romano e Simon Levin comparam as decisões corporativas de descontinuar produtos à apoptose (morte celular programada). “Apoptose, morte e extinção são parte de um espectro de respostas, mas são características essenciais do jogo evolutivo”, explicam eles alegremente enquanto discutem as brincadeiras da diretoria.

Em “O panorama da inovação em bactérias, navios de guerra e muito mais”, Burnham e Travisano comparam o Long-Term Evolution Experiment (LTEE) de Lenski com a guerra naval. “A mensagem da guerra naval e do LTEE é que a competição fomenta a inovação”, dizem eles com aplicações liberais de “seleção” do gênio. Não são permitidos almirantes.

Não são permitidos autores

Em “Como quantificar a forma das histórias prevê seu sucesso”, Toubia, Berger e Eliashberg justificam esse mau hábito darwinista de contar histórias. “Por que algumas narrativas (por exemplo, filmes) ou outros textos (por exemplo, trabalhos acadêmicos) têm mais sucesso do que outros?” Eles começam. Mais uma vez, é devido a um “mecanismo de seleção” que atua silenciosamente nos bastidores. Eles não conseguem ver o que isso faz com suas próprias hipóteses.

Em “Finanças sociais como evolução cultural, viés de transmissão e dinâmica de mercado”, Akçay e Hirshleifer continuam o jogo com o gênio de Darwin. “Nesse paradigma, os vieses de transmissão social determinam a evolução das características financeiras da população investidora”, afirmam. “Ele considera um conjunto enriquecido de traços culturais, tanto a seleção de traços quanto a pressão de mutação e o equilíbrio do mercado em diferentes frequências”.

Em “Moonshots, booms de investimento e viés de seleção na transmissão de traços culturais”, Hirshleifer se junta a Plotkin para aplicar a seleção natural à tomada de risco nos negócios. Pela primeira vez, eles introduzem o raciocínio cognitivo na mistura:

Vemos a adoção ou rejeição do projeto arriscado como um traço cultural transmitido entre as empresas. Empregamos a Equação de Preço para decompor a evolução dessa característica em um componente devido à seleção natural e um componente devido à mutação.

Surpreendentemente, apesar do papel central do viés de seleção na evolução da escolha do projeto no modelo, a fonte predominante de mudança cultural em nosso contexto não é a seleção natural, mas, sim, a pressão de mutação.

A importância da mutação durante a transmissão difere agudamente dos modelos evolucionários culturais com imitação tendenciosa, nos quais existe apenas seleção natural.

Esta característica de nossa análise destaca o papel do raciocínio cognitivo na evolução cultural dos comportamentos de risco.

O raciocínio cognitivo não pode superar o poder do gênio de Darwin, no entanto. “A Equação de Preço decompõe a mudança evolutiva em efeitos de seleção e não seleção”, explicam eles. “O componente de não seleção é frequentemente chamado de pressão de mutação – o grau em que as características mudam através do processo de herança, em vez de replicação enviesada por aptidão.”

Assim, o raciocínio cognitivo degenera em uma forma de pressão de mutação. Isso também acontece no processo de redação de artigos científicos?

Em “Atitudes evoluídas em relação ao risco e à demanda por patrimônio”, Robson e Orr continuam a usar os termos seleção natural, adequação e sobrevivência ao planejamento financeiro. Assumir riscos e escolher pessoas reais com mentes e valores é o mesmo que as estratégias de forrageamento do gado.

Defensores do design, cuidado

Uma teoria tão plástica torna qualquer debate sobre o darwinismo quase impossível de vencer. Enfrente o gênio aqui e ele reaparecerá ali. Ele sempre pode ser mais esperto do que o debatedor mudando de forma para outra forma. A seleção natural é um conceito sem sentido se os professores do prédio de Economia forem como bactérias em evolução em um experimento de evolução de longo prazo.

Esses artigos dão uma aparência de erudição por meio de uma ilusão de rigor matemático (por exemplo, Robson e Orr falam de “Convexo-Côncavo Ψ em Biologia e Economia”), mas o que a seleção natural realmente faz com a explicação científica? Se todas as escolhas e ações humanas se reduzirem a pressões de seleção agindo sobre objetos irracionais, o mundo intelectual implodirá. Até mesmo a redação de artigos científicos sobre “modelos evolutivos de mercados financeiros” torna-se nada mais do que uma estratégia de sobrevivência.

A ultima risada

Em seu ensaio The Abolition of Man, CS Lewis advertiu que o cientificismo é desumanizante para a própria ciência. Os darwinistas são os condicionadores de hoje, ensinando à população a verdadeira natureza das coisas. Eles se veem como vencedores na conquista da Natureza, “explicando” e “enxergando através” dos valores humanos, que agora são “meros fenômenos naturais” como a seleção natural.

Isso não é uma vitória, Lewis diz, mas uma derrota. Não é conquistar a magia medieval, mas abraçá-la. Lewis não supõe que os Condicionadores sejam homens maus; “Eles não são, ao contrário, homens (no sentido antigo) de forma alguma. Eles são, se você preferir, homens que sacrificaram sua própria parte na humanidade tradicional para se devotar à tarefa de decidir o que ‘Humanidade’ passará a significar. ”

A última risada é para o demônio de Darwin. Ele os enganou. Ele se manifestou como um gênio da explicação. Ele prometeu levar-lhes a iluminação, a habilidade de ver através da aparência externa das coisas sua verdadeira natureza. Ele prometeu explicar os valores humanos em termos naturais.

Mas você não pode continuar “explicando” para sempre: você descobrirá que explicou a própria explicação. Você não pode continuar ‘vendo através’ das coisas para sempre. O objetivo de ver através de algo é ver algo através disso. É bom que a janela seja transparente, porque a rua ou jardim além dela é opaca. E se você também visse através do jardim?

Não adianta tentar ‘ver através’ dos primeiros princípios. Se você enxergar através de tudo, então tudo é transparente. Mas um mundo totalmente transparente é um mundo invisível. ‘Ver através’ de todas as coisas é o mesmo que não ver.

Reformulando Histórias De Darwin Em Modelos De Engenharia

Por Evolution News | DiscoveryCSC
2 de julho de 2021, 6h14

Nem toda mudança é “evolução” no sentido darwiniano. Darwin teorizou que toda mudança era o resultado de variações não guiadas de alguma forma “selecionadas” pelo ambiente para o sucesso reprodutivo e sobrevivência. Mas e se os organismos fossem projetados para sobreviver em ambientes mutáveis? E se um projetista tivesse a visão de instalar mecanismos no código genético que se ativariam em circunstâncias estressantes? Os peixes esgana-gata oferecem uma oportunidade de testar essas alternativas.

O esgana-gata de três espinhas tem sido o animal de estimação evolucionário de Michael Bell desde que ele se aposentou da Stony Brook University. Notícias da UC Berkeley contam como ele ficou intrigado com esses peixes de 2,5 “que nadam riachos do Alasca para desovar. Eles são sua versão dos tentilhões de Darwin, “evoluindo” em intervalos de tempo curtos o suficiente para lançar luz sobre os mecanismos de adaptação. Eles têm estado recentemente entre os ícones favoritos dos evolucionistas, demonstrando a verdade da evolução darwiniana.

Michael Bell, atualmente pesquisador associado do Museu de Paleontologia da Universidade da Califórnia na UC Berkeley, encontrou um experimento natural em 1990 no Alasca e, desde então, tem estudado as mudanças físicas que esses peixes sofrem à medida que evoluem e a base genética para estas alterações. Ele até criou seus próprios experimentos, semeando três lagos do Alasca com esgana-gatas oceânicos em 2009, 2011 e 2019, a fim de rastrear sua evolução de peixes oceânicos para peixes de lago de água doce. Este processo parece ocorrer em décadas – muito diferente da lenta evolução que Charles Darwin imaginou – fornecendo aos cientistas uma oportunidade única de realmente observar a adaptação dos vertebrados na natureza. [Ênfase adicionada.]

Escritores do Evolution News comentaram sobre a “evolução” do esgana-gata por anos, argumentando que as mudanças são micro evolucionárias na melhor das hipóteses, simplesmente oscilando para frente e para trás sem ganhos líquidos de aptidão.

O evento CELS no mês passado, porém, proporcionou uma oportunidade de olhar para os dados empíricos de uma perspectiva de engenharia. Esses peixes marinhos estavam equipados com mecanismos para se adaptar quando presos em lagos de água doce, encontrando-se rodeados por diferentes condições ecológicas?

Observações intrigantes para darwinistas

Antes de analisar o artigo científico, observe que a notícia menciona algumas observações que os biólogos darwinistas deveriam achar intrigantes. Por um lado, a “evolução” foi muito rápida: em uma década ou menos, a prole dos peixes capturados havia se ajustado ao novo ambiente. Por outro lado, mudanças genéticas semelhantes foram encontradas em populações que “evoluíram” independentemente. Além disso, o código para adaptação parece estar embutido nos peixes antes que eles se adaptem.

O título do artigo em Science Advances, de Garrett A. Roberts Kingman et al., também parece curiosamente fora de sincronia com o darwinismo tradicional: “Predizendo o futuro a partir do passado: a base genômica da evolução recorrente e rápida do esgana-gatas.”

A evolução darwiniana não é não guiada e, portanto, imprevisível? Dezoito autores, além de Michael Bell, vindos de 11 instituições em 8 estados e uma da Alemanha, participaram desta tentativa heróica de documentar a evolução e elevar o peixe esgana-gata à estatura icônica dos tentilhões de Darwin. Esses pássaros, de fato, figuram com destaque no jornal. A equipe acredita que suas descobertas ajudarão a explicar o sucesso adaptativo dos tentilhões de Darwin e outras espécies que apresentam rápida adaptação a um ambiente alterado.

Formas semelhantes freqüentemente evoluem repetidamente na natureza, levantando questões de longa data sobre os mecanismos subjacentes. Aqui, usamos a evolução repetida em esgana-gatas para identificar um grande conjunto de loci genômicos que mudam recorrentemente durante a colonização de habitats de água doce por peixes marinhos.

Os mesmos loci usados repetidamente em populações existentes também mostram mudanças rápidas de frequência de alelos quando novas populações de água doce são estabelecidas experimentalmente a partir de ancestrais marinhos. Mudanças genotípicas e fenotípicas marcadas surgem dentro de 5 anos, facilitadas pela variação genética permanente e ligação entre as regiões adaptativas. Tanto a velocidade quanto a localização das mudanças podem ser previstas usando observações empíricas de recorrência em populações naturais ou características genômicas fundamentais como idade alélica, taxas de recombinação, densidade de loci divergentes e sobreposição com características mapeadas. Um modelo composto treinado nessas características de esgana-gatas também pode prever a localização dos principais loci evolutivos nos tentilhões de Darwin, sugerindo que características semelhantes são importantes para a evolução em diversos táxons.

Variações Genéticas Permanentes

Um elemento-chave do novo modelo são as Variações Genéticas Permanentes (SGV – sigla em inglês), mencionadas uma dúzia de vezes no artigo. Ao contrário das mutações de novo, que surgem aleatoriamente ao longo do tempo no neodarwinismo tradicional, variações genéticas permanentes já estão presentes dentro de uma população. Além disso, esses “alelos adaptativos antigos” podem ser ligados a outros alelos no que eles chamam de EcoPeaks que conferem sucesso adaptativo ao organismo.

Isso está começando a soar mais como uma programação interna indicativa de previsão? Talvez seja por isso que não há menção operativa da evolução darwiniana, neodarwinismo ou variação / mutação aleatória no artigo. Não é que os autores desacreditem ou desacreditem o antigo neodarwinismo. Eles apenas encontram um processo de curto prazo que é observável e previsível:

Embora a previsibilidade da evolução possa parecer estar em conflito com a imprevisibilidade da contingência histórica, a compreensão do passado pode render importantes insights sobre a evolução futura. Por exemplo, as populações de vertebrados freqüentemente abrigam grandes reservatórios de variação genética permanente (SGV) que dão às populações independentes acesso a material genético bruto semelhante para responder aos desafios ambientais, conforme observado em diversas espécies, incluindo pássaros canoros, peixes ciclídeos e o esgana-gata triospine (Gasterosteus aculeatus) SGV é freqüentemente aparente em espécies ou populações divergentes onde é pré testado por seleção natural e então distribuído por hibridização para populações relacionadas.

Assim filtrado e capaz de saltar sobre paisagens de fitness, o SGV também pode impulsionar uma evolução rápida, ajudando a enfrentar um desafio prático muito real para testar previsões evolutivas: o tempo.

Aha! Isto é rico

Eles basicamente dizem: “Não podemos assistir ao trabalho da seleção natural em tempo real, mas podemos observar as mutações que foram pré-selecionadas para aumentar os picos de aptidão.

Seja em espécies de peixes ou pássaros, os indivíduos podem simplesmente pegar emprestados os alelos pré-adaptados por hibridização e passar por tempos difíceis. Percebe? Afinal, a evolução é previsível! ”

É assim que os darwinistas dogmáticos podem ter seu bolo e comê-lo. As mutações ainda são aleatórias, mas ocorreram no passado invisível. O que temos agora são pools de genes pré-selecionados, capazes de ajudar os organismos a evoluir de forma rápida e previsível. A evolução ainda é um fato!

Os peixes esgana-gata fornecem um excelente sistema para estudos adicionais da base genômica da evolução recorrente. No final da última Era do Gelo, o esgana-gata de três pinheiros, incluindo populações anádromos que migram do oceano para ambientes de água doce para se reproduzir, colonizou e se adaptou a inúmeros ambientes de água doce recém-expostos criados na esteira do recuo das geleiras ao redor do hemisfério norte. Essa radiação adaptativa maciçamente paralela foi facilitada pela seleção natural agindo em extensos SGV antigos. Sob a hipótese do “transportador”, essas variantes são mantidas em baixas frequências nas populações marinhas por baixos níveis de fluxo gênico das populações de água doce.

A reutilização de antigas variantes permanentes permitiu a identificação de conjuntos de loci em todo o genoma que são repetidamente diferenciados entre populações de esgana-gata estabelecidas há muito tempo.

Além disso, o SGV permite que novas populações de esgana-gatas de água doce evoluam acentuadamente em décadas, incluindo mudanças fenotípicas conspícuas nas placas de blindagem e no formato do corpo.

E se, em vez disso, esses alelos adaptativos fossem projetados? Uma inteligência projetista teria a clarividência para fornecer aos organismos um kit de ferramentas para se adaptarem a ambientes alterados. Nesse caso, seria de se esperar que os organismos já possuíssem as ferramentas (variação genética permanente) ou um meio de obtê-las (hibridização). Seria de se esperar que as populações se adaptassem rápida e independentemente, não gradualmente. Consequentemente, o registro fóssil seria caracterizado por lacunas sistemáticas. Qual modelo se encaixa nas evidências?

Informações adaptativas pré-testadas

Os evolucionistas têm reclamado sobre lacunas no registro fóssil muito antes de Stephen Jay Gould falar deles como o “segredo comercial da paleontologia”. As lacunas foram explicadas por equilíbrios pontuados e outros dispositivos de resgate, argumentando que a evolução ocorreu de forma muito rápida para deixar fósseis, mas de forma muito lenta para se observar. Bem, esses 19 autores agora estão dizendo que a adaptação pode ser observada, mas o que acontece não é a seleção natural de mutações aleatórias. É o compartilhamento genético de informações adaptativas pré-testadas. É por isso que os tentilhões de Darwin se adaptam rapidamente às secas e à disponibilidade de fontes de alimento.

É por isso que os peixes esgana-gatas podem ganhar e perder armadura, dependendo da ecologia da predação. Os autores insistem que seu modelo melhora a velha teoria evolucionária:

A importância do SGV para a evolução está se tornando cada vez mais aparente, especialmente em espécies com grandes tamanhos de genoma, incluindo humanos. À primeira vista, a dependência do esgana-gata de três pinheiros do SGV para a adaptação em água doce pode parecer uma peculiaridade em termos de repetibilidade e velocidade e sua história natural particular. No entanto, ao compreender de forma mais abrangente a dinâmica deste processo altamente otimizado, extraímos características gerais da arquitetura e evolução do genoma que se traduzem com sucesso em espécies em ramos distantes da árvore da vida, demonstrando assim o tremendo poder do sistema do esgana-gata para identificar princípios unificadores que fundamentam a mudança evolutiva.

Mas se este é um “processo altamente otimizado” em torno da árvore da vida (ou, melhor, rede da vida ), como é darwiniano? O artigo diz muito pouco sobre adequação, sobrevivência e especiação – termos que costumavam ser peças centrais da teoria da evolução. A ideia de evolução progressiva também é meramente assumida, não demonstrada:

Isso sugere que regiões individuais podem crescer ao longo do tempo, com alelos originalmente baseados em uma mutação benéfica inicial acumulando mutações favoráveis adicionais ligadas, tornando-se uma bola de neve ao longo do tempo para formar um haplótipo perfeitamente ajustado com múltiplas mudanças adaptativas. Isso é consistente com o trabalho em outras espécies, identificando exemplos de evolução por meio de múltiplas mutações ligadas que, juntas, modificam a função de um gene (50-52) e implica que a melhoria alélica progressiva pode ser comum .

Seus três exemplos nas referências, no entanto, referem-se apenas aos efeitos regulatórios sobre os genes existentes – não à origem das espécies que Darwin desejava explicar.

Seu novo modelo realmente parece projetado: os organismos podem tomar emprestado o conhecimento existente fornecido a eles em uma vasta biblioteca de SGV.

Sem necessidade de desculpas

Os biólogos conhecedores da engenharia de hoje não precisam das velhas desculpas para resgatar o gradualismo do neodarwinismo, que contradiz as evidências fósseis.

Os alelos adaptativos podem ser vistos não como um conjunto aleatório de erros aleatórios pré-filtrados que simplesmente funcionam. Eles são conjuntos de ferramentas para sobreviver em um mundo dinâmico.

Este novo artigo, que não fornece nenhuma evidência de aleatoriedade ou gradualismo, propõe uma estratégia de rede distribuída que parece um bom design. Assim como cada carro não precisa carregar todas as ferramentas se puder ser obtido em um depósito, cada organismo não precisa carregar todos os alelos adaptativos possíveis se puder obter o que precisa na biblioteca da população.

Essa é uma estratégia de design que biólogos com conhecimento de engenharia podem desejar desenvolver, usando este artigo ( sans seus pressupostos neodarwinistas) como evidência.

Reconhecendo O Design Por Um “Arranjo Proposital De Peças”

Por Michael Behe | Evolution News

10 de junho de 2021, 15:15

Um correspondente perguntou sobre “complexidade especificada” e o design inteligente do olho.

Expliquei por que prefiro muito mais a frase “arranjo proposital de partes” como um critério para design – versus complexidade irredutível, complexidade especificada, pequena probabilidade especificada, informação, informação complexa especificada ou outras frases.

A diferença crítica entre o DI e a evolução darwiniana (e todas as outras propostas para processos evolutivos não inteligentes) é o envolvimento de uma mente no DI.

A filósofa Lydia McGrew escreveu certa vez que a questão básica do DI se resume à questão de “outras mentes“. Uma das reivindicações famosas de Alvin Plantinga é a que ele argumentou cinquenta anos atrás em God and Other Minds que (eu parafraseio) a percepção da existência de Deus é o mesmo tipo de problema que a percepção da existência de outras mentes.

Mentes e Propósito

Então, como percebemos o trabalho de uma mente? Como escrevi em meus livros (mais extensivamente em Darwin Devolves), mentes (e apenas mentes) podem ter objetivos.

Assim, na medida em que pode manipular as coisas, a mente pode organizar as partes para atingir seus objetivos. Claro, nós mesmos temos mentes. E é um poder fundamental da mente poder discernir propósitos. Assim, podemos reconhecer que uma mente agiu ao perceber um arranjo proposital de partes. Não há outra maneira que eu possa imaginar pela qual possamos reconhecer uma outra mente.

Para fins de detecção de outras mentes, “partes” podem ser virtualmente qualquer coisa. Os exemplos incluem: o arranjo proposital de sons na fala; palavras e letras por escrito; peças mecânicas em máquinas; o momento dos eventos em uma festa surpresa; combinações de todas essas coisas; e um número infinito de outras maneiras.

Há muitas outras coisas a dizer para preencher isso que não posso abordar aqui (especialmente a questão dos “spandrels“, ou seja, recursos que não são intencionais para eles mesmos, mas são os efeitos colaterais da construção de sistemas projetados). No entanto, o ponto principal é que só podemos reconhecer design/mente no arranjo proposital das peças.

Zeros e Uns

Outras frases que as pessoas usam para indicar design inteligente se resumem a arranjos de partes intencionais.

Por exemplo, Stephen Meyer gosta de apontar que sabemos que agentes inteligentes produzem informações, então, quando encontramos informações codificadas em um programa de computador, podemos concluir que foram produzidas por um agente inteligente. É verdade. No entanto, como sabemos que há informações em uma sequência de zeros e uns – em um programa de computador? Somente se descobrirmos que eles são organizados com um propósito; isto é, se o programa de computador tem uma função, se pode fazer algo significativo.

Da mesma forma, sistemas irredutivelmente complexos resistem à explicação darwiniana, mas como sabemos que eles são projetados? Porque vemos que eles podem fazer algo, que eles têm um propósito, eles são um arranjo proposital de partes. (À parte, os sistemas de CI têm duas propriedades relevantes – sua natureza descontínua resiste ao darwinismo e sua intencionalidade manifesta aponta fortemente para o design.)

Finalmente, no caso do olho, em vez de “complexidade especificada”, acho que é muito, muito mais fácil analisar o design para um público leigo (ou profissional) como um arranjo proposital de partes. O público reconhecerá imediatamente o propósito na disposição dos componentes do olho. Em minha opinião, a frase complexidade especificada apenas obscurece o mesmo significado encontrado em um arranjo proposital.

O “especificado” na frase complexidade especificada é praticamente o mesmo que “proposital” e “complexidade” o mesmo que “arranjo“. No entanto, a frase “arranjo proposital” é ao mesmo tempo menos matemática, menos proibitiva, mais acessível e mais clara.

Vindicado, mas não citado: Paper na Nature Heredity apoia a hipótese de devolução de Michael Behe

Por Casey Luskin | Evolution News

A natureza não dá saltos

Por Cornelius Hunter | DarwinsPredictions

A evolução é um processo. Ocorre gradualmente por meio de variações dentro das populações. O ritmo pode variar, mas “o cânone de ‘Natura non facit saltum‘”, como Darwin explicou, era “inteligível nessa teoria”. Mas hoje isso não é mais verdade. O primeiro problema, que as espécies apareceram abruptamente nos estratos, pode ser explicado como um registro fóssil irregular, embora trechos incríveis de progresso evolutivo devam ter desaparecido.

Mas o registro fóssil não é a única evidência de saltos. Desde Darwin, mudanças rápidas foram observadas diretamente em espécies que variam de bactérias e leveduras a plantas e animais. Considere os tentilhões domésticos que começaram a se espalhar pelos Estados Unidos na década de 1940, vindos do México e do sudoeste. Os bicos dessas aves adaptaram-se aos novos ambientes com grande velocidade. Em mais ou menos uma década, seus bicos se ajustaram aos novos habitats. (Grant) Em outro exemplo, os lagartos de parede italianos introduzidos em uma pequena ilha na costa da Croácia responderam rapidamente, desenvolvendo uma nova morfologia da cabeça e estrutura do trato digestivo. (Herrel, et. Al. ) Tal mudança “normalmente levaria milhões de anos para acontecer…” (Johnson) Da mesma forma, mexilhões introduzidos em um novo ambiente evoluíram “em um nanossegundo evolutivo em comparação com os milhares de anos anteriormente assumidos. (Os mexilhões evoluem rapidamente para se defenderem contra caranguejos invasores) Esses exemplos de adaptação não são novos, e um evolucionista concluiu que “a evolução pode ocorrer muito mais rapidamente do que pensávamos anteriormente. A evolução rápida é generalizada e a lista de exemplos está crescendo. (A evolução rápida ajuda os caçados a superar seus predadores)

Tudo isso significa que a evolução pode precisar de um novo mecanismo de mudança. Na verdade, parece duvidoso que pequenas variações biológicas levem a mudanças em grande escala. Como disse um evolucionista, a macroevolução é mais do que rodadas repetidas de microevolução. (Irwin) Cada vez mais os evolucionistas têm reconhecido a necessidade de um novo mecanismo para explicar a mudança evolutiva. (Gould, 579, 582) Nos últimos anos, os evolucionistas consideraram precisamente o que Darwin descartou: a evolução saltacional. aqui estão alguns exemplos:

À medida que a natureza salta, o gradualismo exclusivo é descartado. A evolução saltatória é um fenômeno natural, proporcionado por um colapso repentino dos limiares que resistem à evolução. O registro fóssil e o sistema taxonômico requerem uma interpretação macromutacional. (van Waesberghe)

Oferecemos evidências de três instâncias independentes de evolução saltacional em um gênero de mariposa encantadora com apenas oito espécies. … Cada espécie saltacional exibe um exemplo distinto e marcadamente diferente de evolução de característica descontínua. (Rubinoff e Le Roux)

As principais transições na evolução biológica mostram o mesmo padrão de emergência repentina de diversas formas em um novo nível de complexidade. As relações entre os grupos principais dentro de uma nova classe emergente de entidades biológicas são difíceis de decifrar e não parecem se encaixar no padrão de árvore que, seguindo a proposta original de Darwin, continua sendo a descrição dominante da evolução biológica. Os casos em questão incluem a origem de moléculas complexas de RNA e dobras de proteínas; principais grupos de vírus; archaea e bactérias, e as linhagens principais dentro de cada um desses domínios procarióticos; supergrupos eucarióticos; e filos animais. Em cada um desses nexos essenciais na história da vida, os principais “tipos” parecem aparecer rápida e totalmente equipados com os traços característicos do respectivo novo nível de organização biológica. Não são detectáveis “graus” intermediários ou formas intermediárias entre tipos diferentes. (Koonin)

Aqui fornecemos, pela primeira vez, evidências de grande saltação fenotípica na evolução do número do segmento em uma linhagem de centopéias. (Minelli, Chagas-Júnior e Edgecombe)


Títulos de artigos de pesquisa, que incluem frases como “adeus ao darwinismo, neo e outros“, “quando natura non facit saltum se tornar um mito“, “Evolução saltacional: monstros esperançosos estão aqui para ficar” e “uma Neo-Goldschmidtian visão de monstros esperançosos unicelulares”, destacam esta falsificação da previsão da evolução de que não há saltos.


Referências
Gould, Steven Jay. 2002. The Structure of Evolutionary Theory. Cambridge: Belknap Press.

Grant, B. 2010. “Should Evolutionary Theory Evolve?.” TheScientist January 1.

Herrel, A., et. al. 2008. “Rapid large scale evolutionary divergence in morphology and performance associated with the exploitation of a novel dietary resource in the lizard Podarcis sicula.” Proceedings of the National Academy of Sciences 105:4792-4795.

Irwin, D. 2000. “Macroevolution is more than repeated rounds of microevolution.” Evolution & Development 2:61-62.

Johnson, K. 2008. “Lizards rapidly evolve after introduction to island.” National Geographic News April 21.

Koonin, E. 2007. “The Biological Big Bang model for the major transitions in evolution.” Biology Direct 2:21.

Minelli, A., A. Chagas-Júnior, G. Edgecombe. 2009. “Saltational evolution of trunk segment number in centipedes.” Evolution & Development 11:318-322.

“Mussels evolve quickly to defend against invasive crabs.” 2006. ScienceDaily August 11. http://www.sciencedaily.com/releases/2006/08/060811091251.htm

“Rapid Evolution Helps Hunted Outwit Their Predators.” 2003. NewsWise July 16.
http://www.newswise.com/articles/view/?id=500152&sc=wire

Rubinoff, D., J. Le Roux. 2008. “Evidence of repeated and independent saltational evolution in a peculiar genus of sphinx moths (Proserpinus: Sphingidae).” PLoS One 3:e4035.

van Waesberghe, H. 1982. “Towards an alternative evolution model.” Acta Biotheoretica 31:3-28.

Preso Na Parábola Naturalística

Paul Nelson | Evolution News

17 de junho de 2020, 14h55

Os princípios de um coletivo [de pensamento] estranho são, se percebidos, considerados arbitrários e sua possível legitimidade como imploração de petição. A forma estranha de pensamento parece misticismo. As perguntas que ela rejeita serão freqüentemente consideradas as mais importantes, suas explicações como nada provando ou como errando o alvo, seus problemas como trivialidades freqüentemente sem importância ou sem sentido.

LUDWIK FLECK, 1935 

Quando os paradigmas entram, como devem, em um debate sobre a escolha do paradigma, seu papel é necessariamente circular. Cada grupo usa seu próprio paradigma para argumentar em defesa desse paradigma.

TS KUHN, 1970

… Um grande abismo foi colocado entre nós, de modo que aqueles que querem passar deste lado para você não podem fazê-lo, nem podem cruzar do seu lado para cá.

LUCAS 16:26

Não tente o impossível

Bom conselho, certo? Trissecar um ângulo usando apenas uma bússola e uma régua não marcada, dividindo por zero, usando seu telefone celular dentro de uma gaiola de Faradayreanimando uma lata de arenque defumado, encontrando um apartamento com preço razoável em São Francisco… não, não, não, não, não. Nem se preocupe em tentar. 

Falando em impossibilidade, você deve ter notado um estranho ciclo que surge espontaneamente em muitos setores do debate do design inteligente. Este estranho loop – que descrevo abaixo, com exemplos detalhados deixados para outra ocasião – é filosoficamente fascinante, mas também, como outros quebra-cabeças intratáveis, uma fonte de perplexidade sem fim. Parece impossível, uma vez que alguém está preso no loop, escapar para o plano onde o progresso racional poderia ser feito.

A metáfora de um “laço estranho” é útil, mas para este quebra-cabeça em particular, prefiro outra imagem: uma parábola. A Figura 1 mostra esta seção cônica familiar, com suas partes etiquetadas. Como você deve se lembrar da geometria do ensino médio, as parábolas se estendem infinitamente ao longo de seu eixo de simetria.

Figura 1. Crédito da imagem: Melikamp / CC BY-SA.


Estenda infinitamente – no que segue, essa será a propriedade definidora a ter em mente. Considere a seguir um diálogo representativo entre um evolucionista (chame-o de Evolver) e um proponente do design inteligente (chame-o de Designer) sobre um aspecto da origem da vida: a formação prebiótica de proteínas.

Designer: A formação de proteínas a partir de aminoácidos não pode ocorrer em um ambiente prebiótico aquoso. A hidrólise vai atacar as ligações peptídicas – 

Evolver: Desculpe-me por interromper, mas não é assim que as proteínas se formam.

Designer: No modelo Oparin-Haldane – 

Evolver: Você quer dizer o espantalho Oparin-Haldane?

Designer: Mas seu “caldo orgânico fino em uma atmosfera redutora” foi o cenário prebiótico principal durante grande parte do século XX.

Evolver: Olá, estamos em 2020. O campo mudou. Existem proteínas, então usar um modelo de sopa pré-biótica para sua origem, quando já sabemos que não funciona, não pode estar certo. Você precisa abordar a via prebiótica real que ocorreu, não alguma hipótese antiga e errônea.

Designer: Tudo bem, qual é a verdadeira via prebiótica para as proteínas?

Evolver: Estamos trabalhando nisso. O ônibus da turnê está saindo, tente acompanhar.

Ok, então o que está acontecendo aqui?

Poderíamos continuar esse diálogo indefinidamente, com o Designer criticando como impraticável, ou falsa, todas as hipóteses de origens de proteínas prebióticas apresentadas pelo Evolver – e ainda assim o Evolver permanece ali, imperturbável, bocejando e verificando as mensagens em seu iPhone.

E isso porque o Evolver não está comprometido com a suficiência causal, ou verdade, de nenhuma hipótese científica específica sobre a origem das proteínas. Em vez disso, ele está empenhado em encontrar uma resposta de uma determinada forma filosófica – ou seja, que o caminho, seja o que for, ocorreu por meio de um processo físico não direcionado. Esse caminho ainda desconhecido, uma vez que seja descoberto e funcione, marcará o alcance do ponto final que define o sucesso na dimensão da origem das proteínas da pesquisa em abiogênese.

Até então? Continue procurando.

Se dissecarmos o raciocínio do Evolver, portanto, e colocarmos suas peças na bancada do laboratório, elas se parecerão com isto:

  1. Existem proteínas.
  2. Assim, também existe algum caminho natural da química para as proteínas.
  3. A tarefa da ciência é encontrar (2), a fim de explicar (1).
  4. Até que essa tarefa seja concluída, a pesquisa sobre abiogênese continua.

O que essas proposições, (1) a (4), significam para o Designer? 

Preso como um rato filosófico

Em suas discussões com o Evolver sobre a origem das proteínas (ou qualquer objeto ou sistema biológico, nesse caso), o Designer ficará preso para sempre dentro da Parábola Naturalística.

O designer está condenado à frustração perpétua, do pior tipo – absoluta impossibilidade. Nada do que ele possa dizer ao Evolver, desde que o Evolver siga consistentemente sua premissa de definição de parábola, fará a mínima diferença. Sísifo entenderia.

Lembra daquela propriedade das parábolas mencionada acima – sua extensão infinita? Suponha que inclinemos a parábola da Figura 1 de lado e a posicionemos ao lado de uma linha do tempo (Figura 2).

Figura 2.


Enquanto a Parábola Naturalística se define hoje por uma regra filosófica, podemos dizer que seu vértice temporal – seu ponto de partida na história da ciência – se situa por volta de 1859, com a publicação da Origem das Espécies de Darwin. Seu fim, entretanto, não está à vista.

Em nenhum lugar à vista – porque nenhum número finito de falsificações científicas (isto é, de hipóteses individuais para eventos como a origem de proteínas) pode refutar a regra filosófica incondicional que define a Parábola Naturalística:

As declarações da ciência devem invocar apenas coisas e processos naturais.

Assim disse a National Academy of Sciences em 1998. Esta é a regra do naturalismo metodológico (MN). MN não é uma proposição científica. É um dito priori e, como tal, não pode ser refutado ou testado pela observação.

Agora, você pode pensar que o MN é desnecessário, ou mesmo doentio, para a prática da ciência. (Em outra ocasião, espero discutir o fato surpreendente de que muitos cientistas e filósofos ateus discordam veementemente do MN, quando o MN é proclamado como uma regra incondicional.) A Academia Nacional, no entanto, não está ouvindo você, nem os tribunais federais, nem são organizações como a American Federation of Teachers – todos os órgãos oficiais cujas atribuições incluem a definição de “ciências” para a prática acadêmica e políticas públicas, em questões como currículos, decisões de financiamento, emprego e revisão por pares.

Tudo bem: colocamos um problema sério na mesa para discussão. É muito parecido com o diálogo entre o Evolver e o Designer, apesar de seu aparente envolvimento nas mesmas questões científicas – por exemplo, como a vida começou? – não é de todo um diálogo genuíno.

É, antes, um exercício de futilidade. De um lado, o Designer se convenceu de que as evidências vão contra as hipóteses científicas apresentadas pelo Evolver e que, ao se concentrar naquele ponto – a evidência desconfirmada – o Designer está fazendo o que conta. Se ao menos eu pudesse persuadir o Evolver de que suas hipóteses não funcionam, pensa o designer, o Evolver mudará de ideia sobre a origem das proteínas e, por fim, a origem da vida. 

Pobre Designer iludido, diz o Evolver a si mesmo – ele é realmente ingênuo. Não há como escapar da parábola. Ele comanda o show.

Prospecto

Neste ponto, poderíamos olhar o que aconteceu durante a Revolução Darwiniana e, a partir daí, criar a Parábola Naturalística. Poderíamos ver alguns exemplos de como a Parábola funciona – frases comuns que dizem: “Ei, você está preso na Parábola: pare de chutar e saia”. Poderíamos fornecer as instruções de fuga da parábola. Tudo no seu devido tempo.

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Notas:

  1. Ludwik Fleck, Genesis and Development of a Scientific Fact (Chicago: University of Chicago Press, 1979 [1935]), p. 109.
  2. Thomas S. Kuhn, The Structure of Scientific Revolutions (Chicago: University of Chicago Press, 1970), p. 94.
  3. Trisecting an angle with a compass and unmarked straight edge, and dividing by zero, are mathematical impossibilities; cell phone usage in a Faraday cage is a physical impossibility; spontaneous generation (bringing the herring back to life) is a biological impossibility; whereas finding an affordable apartment in San Francisco is not impossible at all, but only a practical nightmare which supplies grade-AAA material for musing about the inequities of life.
  4. Working Group on Teaching Evolution, National Academy of Sciences, Teaching About Evolution and the Nature of Science (Washington, DC: National Academy Press, 1998), p. 42.
  5. If you doubt this, ask yourself what imaginable observation would refute MN. 

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Imagem: Detalhe de Sísifo, de Ticiano, no Museu do Prado, Domínio público.

DNA Funcionalmente Irrestrito Não É Conservado

Por Cornelius Hunter | DarwinsPredictions

À medida que diferentes espécies evoluem, seus segmentos de DNA são preservados apenas se contribuírem para a aptidão do organismo. Os segmentos de DNA que não são funcionalmente restritos devem sofrer mutação e divergir ao longo do tempo. O resultado é que segmentos de DNA semelhantes, mas sem restrições funcionais, não devem ser encontrados em espécies distantes. O corolário dessa previsão é que sequências de DNA semelhantes encontradas em espécies distantes devem ser funcionalmente restritas.

Essa previsão foi falsificada em muitos exemplos de trechos de DNA funcionalmente irrestritos e altamente semelhantes que foram descobertos em espécies distantes. Por exemplo, milhares dos chamados elementos ultra-conservados (UCEs), centenas de pares de bases de comprimento, foram encontrados em uma variedade de espécies, incluindo humanos, camundongos, ratos, cães, galinhas e peixes. Na verdade, nas diferentes espécies, algumas dessas sequências são 100% idênticas. As espécies que deveriam ter evoluído independentemente por 80 milhões de anos certamente não deveriam ter segmentos de DNA idênticos. “Quase caí da cadeira”, comentou um evolucionista. (Lurie) “Não pode ser verdade” comento uma evolucionista. (Pennisi)

Os evolucionistas presumiram que essas sequências altamente preservadas devem ter uma função importante. Mas os estudos de laboratório não revelaram quaisquer efeitos significativos em ratos. Uma variedade de experimentos foi feita para determinar a função dessas sequências que a evolução supostamente preservou. Mas em muitas das regiões nenhuma função foi encontrada. Um estudo excluiu várias regiões UCE, incluindo um trecho de 731 pares de bases de DNA que foi hipotetizado para regular um gene crucial. Os evolucionistas esperavam que a remoção resultasse em letalidade ou infertilidade, mas em vez disso encontraram ratos normais e saudáveis. Meses de observação e uma bateria de testes não encontraram anormalidades ou diferenças significativas em comparação com ratos normais. (Ahituv, et. Al.) Como um dos principais pesquisadores explicou:

Para nós, foi um resultado realmente surpreendente. Esperávamos demonstrar o papel vital que esses elementos ultra-conservados desempenham, mostrando o que acontece quando eles estão ausentes. Em vez disso, nossos camundongos knockout não eram apenas viáveis e férteis, mas não apresentavam anormalidades críticas no crescimento, longevidade, patologia ou metabolismo. (Os camundongos prosperam sem sequências de DNA antigas)

Outro estudo eliminou duas regiões de DNA massivas e altamente conservadas de 1,5 milhão e 0,8 milhões de pares de bases em ratos de laboratório e, novamente, os resultados foram ratos viáveis, indistinguíveis dos ratos normais em todas as características que mediram, incluindo crescimento, funções metabólicas, longevidade e desenvolvimento geral. (Nóbrega, et. Al.) “Ficamos bastante surpresos”, explicou o pesquisador principal. (Westphal)

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Referências
Ahituv, N., Y. Zhu, A. Visel, A. Holt, V. Afzal, L. Pennacchio, E. Rubin. 2007. “Deletion of ultraconserved elements yields viable mice.” PLoS Biol 5:e234.
Lurie, Karen. 2004. “Junk DNA.” ScienCentral July 20.
“Mice thrive missing ancient DNA sequences.” 2007. ScienceDaily September 6. http://www.sciencedaily.com/releases/2007/09/070904151351.htm
Nobrega, M., Y. Zhu, I. Plajzer-Frick, V. Afzal, E. Rubin. 2004. “Megabase deletions of gene deserts result in viable mice.” Nature 431:988-993.
Pennisi, Elizabeth. 2004. “Disposable DNA puzzles researchers.” Science 304:1590-1591.

Westphal, S. 2004. “Life goes on without ‘vital’ DNA.” New Scientist June 3.

Novembro: Em Um Novo Livro, Michael Behe Cria Uma Armadilha Para Darwin

By Evolution News

Em 1996, a Caixa Preta de Darwin colocou Michael Behe na vanguarda do movimento de design inteligente que estava surgindo. O bioquímico da Lehigh University e pesquisador sênior do Discovery Institute tem assombrado os sonhos dos darwinistas desde então. Cada um de seus três livros gerou uma tempestade de críticas, em tudo, desde o New York Times e o jornal Science até os blogs privados de ateus profissionais. Behe diz que se divertiu refutando cada ataque. E agora a maior parte de suas respostas são coletadas em A Mousetrap for Darwin, com lançamento programado para o próximo mês pela Discovery Institute Press.

* Celebraremos o livro com um webinário ao vivo em 21 de novembro. Registre-se aqui agora porque as vagas são limitadas!

O livro inclui mais de cem de seus ensaios, juntamente com várias peças originais, incluindo uma nova introdução, epílogo e detalhes dos bastidores sobre algumas de suas batalhas com cientistas conhecidos e, em um caso, um juiz federal. A lógica afiada de Behe, o senso de humor irônico e o estilo acessível estão em exibição por toda parte.

O título do volume alude à ilustração caseira de Behe de complexidade irredutível. Como Behe explica, uma ratoeira comum com uma parte faltando não funciona um pouco pior. Ela não funciona de jeito nenhum. É irredutivelmente complexa. O mesmo vale para o motor do flagelo bacteriano retratado na capa do livro. Idem para uma série de outras máquinas moleculares engenhosas. Entretanto, o processo darwiniano não pode selecionar um estágio não funcional que esteja no caminho para alguma função futura. Então, como a evolução cega poderia organizar as partes bioquímicas nesses complexos todos funcionais, num pequeno passo de cada vez, como Darwin e seus seguidores imaginam? Behe diz que uma série de evidências recentes – desde o estudo da evolução de micróbios até as mutações em cães e ursos polares – sugere que não. Em vez disso, a evolução funciona principalmente quebrando coisas para benefício de curto prazo.

O que pode? Design inteligente.

Behe diz que um dos melhores indicadores de que ele está no caminho certo é a pura vacuidade dos ataques dirigidos contra ele, muitos oferecidos por cientistas inegavelmente brilhantes. Seus críticos rotineiramente descaracterizam seus argumentos, atacando espantalhos em vez do que ele realmente disse. O novo volume deixa isso bem claro.

Alguns dos críticos de Behe também gostam de afirmar que ele ignorou esta ou aquela crítica relevante. Mas Behe respondeu, normalmente em locais bastante proeminentes – de forma clara, convincente e, na maioria dos casos, com seu bom humor inimitável. A prova está em A Mousetrap for Darwin.

O volume é dividido em oito seções e cobre os debates estimulados pela Caixa Preta de Darwin (1996), o teste de design inteligente de Dover, The Edge of Evolution (2007) e, mais recentemente, Darwin Devolves (2019).

Ajude-nos a celebrar Mike Behe e sua longa e valente luta pela verdade científica! Junte-se a nós em 21 de novembro.


[* O evento ocorrerá nos EUA]

Estruturas Não Evoluem Antes De Serem Necessárias

By Cornelius Hunter | DarwinsPredictions

Uma premissa fundamental da teoria da evolução é que a evolução não tem previsão. É um processo cego que responde às necessidades atuais, não futuras. Isso significa que as estruturas biológicas não evoluem antes de serem necessárias. Mas muitos exemplos disso foram descobertos nos últimos anos. Por exemplo, nos estágios embrionários de uma ampla variedade de organismos, o desenvolvimento do sistema de visão é orquestrado por genes de controle semelhantes, conhecidos como fatores de transcrição. Como um artigo explicou, “Todos os olhos, invertebrados e vertebrados, se desenvolvem por meio de uma cascata de fatores de transcrição semelhantes, apesar das vastas distâncias filogenéticas. (Wake, Wake and Specht)

Como esses fatores de transcrição são tão prevalentes na árvore evolutiva, eles devem ter evoluído nos estágios iniciais da evolução, em um ancestral comum inicial. Mas isso foi antes de qualquer sistema de visão ter evoluído. O sistema de visão é apenas um dos vários exemplos que mostram que os componentes genéticos de muitas das atuais vias de desenvolvimento embrionário devem estar presentes muito antes de tais vias existirem. Os evolucionistas agora se referem ao aparecimento desses componentes genéticos, antes de serem usados como tais, como pré adaptação :

Comparações de genomas mostram que os primeiros clados contêm cada vez mais genes que medeiam o desenvolvimento de características complexas vistas apenas em ramos metazoários posteriores… A existência de elementos principais do kit de ferramentas de desenvolvimento bilateral nesses organismos mais simples implica que esses componentes evoluíram para outras funções além da produção de morfologia complexa, pré-adaptando o genoma para a diferenciação morfológica que ocorreu proeminente na filogenia dos metazoários. (Marshall e Valentine)


Essa pré-adaptação vai além do desenvolvimento embrionário. Por exemplo, vários componentes-chave do cérebro humano são encontrados em organismos unicelulares chamados coanoflagelados. Portanto, esses componentes-chave devem ter evoluído em organismos unicelulares, muito antes dos animais, cérebros e células nervosas existirem. Como explicou um evolucionista: “Os coanoflagelados têm muitos precursores para coisas que pensávamos estar presentes apenas em animais”. (Marshall)
Outro exemplo são as máquinas moleculares para o transporte de proteínas através da membrana interna da mitocôndria, que deve ter evoluído muito antes das mitocôndrias existirem. (Clements et. Al.)

Como explicou um evolucionista: “Você olha para as máquinas celulares e diz: por que diabos a biologia faria algo assim? É muito bizarro. Mas quando você pensa sobre isso de uma forma evolucionária neutra, em que essas máquinas surgem antes que haja uma necessidade delas, então faz sentido”. (Keim)


Referências

Clements, A., D. Bursac, X. Gatsos, et. al. 2009. “The reducible complexity of a mitochondrial molecular machine.” Proceedings of the National Academy of Sciences 106:15791-15795.

Keim, Brandon. 2009. “More ‘Evidence’ of Intelligent Design Shot Down by Science.” Wired Aug. 27. http://www.wired.com/wiredscience/2009/08/reduciblecomplexity/

Marshall, Michael. 2011. “Your brain chemistry existed before animals did.” NewScientist September 1.

Marshall C., J. Valentine. 2010. “The importance of preadapted genomes in the origin of the animal bodyplans and the Cambrian explosion.” Evolution 64:1189-1201.

Wake D., M. Wake, C. Specht. 2011. “Homoplasy: from detecting pattern to determining process and mechanism of evolution.” Science 331:1032-1035.